В рамките на жизнения цикъл на семената на растенията семената се намират в състояние на покой преди етапите на покълване. По време на периодите на покой се проявява малко активност, тъй като семената чакат подходящите условия на околната среда за растеж. След като покълването започне, скоростта на клетъчно дишане се увеличава драстично, за да осигури необходимите материали за началните етапи на растеж на растенията.
Процесите на клетъчно дишане осигуряват средство за клетките да преобразуват съществуващите хранителни материали в енергия. По време на периоди на покой, растителните семена отпочиват достатъчно, за да поддържат храна или хранителни запаси в рамките на специализиран семенен слой, известен като ендосперм. В рамките на цъфтящите растения ендоспермните структури са продукт на процес на двойно оплождане, който се осъществява, когато за първи път се оплоди яйцеклетка или яйчник на растението. Всъщност ендоспермът осигурява нуждите на семето от хранителни вещества и изпълнява необходимите функции на клетъчното дишане през целия период на покой. Началото на покълването поставя значителни енергийни нужди върху семената, тъй като процесите на растеж на растежа се оформят. В резултат на това скоростите на клетъчно дишане се увеличават, за да се приспособят клетъчно изграждащите дейности, необходими за разтваряне на семената и създаване на първоначалните коренови и стволови структури.
Растителните семена произхождат от цветя, плодове, зелени растения и дървета, които растат в безброй условия на околната среда. Не е изненадващо, че всеки тип семена търси определени задействания от околната среда, които подтикват началото на процесите на покълване. Според университета Корнел, екологичните задействания могат да се появят като повишени нива на хранителни вещества в почва, промени в температурата на почвата, увеличени количества валежи или повишаване на количеството и качеството на светлина. След като се изпълнят необходимите условия, семената започват да увеличават степента на абсорбция на вода, което бележи началото на покълването. Увеличаването на абсорбцията на вода позволява на семената да мобилизират хранителни запаси, съхранявани в ендоспермните слоеве. Тези процеси активират определени ензими, които предизвикват повишаване на клетъчната честота на дишане на семената.
Покълващите семена извършват процесите на клетъчно дишане по същия начин, както растителните и животинските клетки. Клетъчното дишане се осъществява на три етапа, започвайки с гликолиза. Етапът на гликолиза използва молекули глюкоза за производство на две единици енергия или молекули АТФ (аденозин трифосфат) заедно с други химични материали. Цикълът на Кребс съставлява втория етап на клетъчното дишане. Този етап използва продуктите от гликолиза, за да произведе още две енергийни единици и трансформира химикалите, останали от гликолизата, в молекули, пренасящи водород. Електронната транспортна верига е третият етап в процеса на дишане и се захранва от двете молекули АТФ, произведени в цикъла на Кребс. Този етап комбинира енергията, съдържаща се в молекулите на водорода от цикъла на Кребс, с кислорода, за да създаде 38 молекули АТФ. Този тристепенен процес се повтаря отново и отново във всяка отделна растителна клетка. Молекулите на АТФ, произведени от клетъчното дишане, осигуряват енергия за започване на покълването на семената и подхранват дейностите по изграждане на клетки, които в крайна сметка формират растителното тяло.