Хроматографските техники се извършват в научни лаборатории за отделяне на химични съединения от неизвестна проба. Пробата се разтваря в разтворител и протича през колона, в която се отделя чрез привличане на съединението към материала на колоната. Това полярно и неполярно привличане към материала на колоната е активната сила, която кара съединенията да се отделят с течение на времето. Двата вида хроматография, използвани днес, са газова хроматография (GC) и високоефективна течна хроматография (HPLC).
Газовата хроматография изпарява пробата и тя се пренася по системата от инертен газ като хелий. Използването на водород води до по-добро разделяне и ефективност, но много лаборатории забраняват използването на този газ поради запалимостта му. Когато се използва течна хроматография, пробата остава в течно състояние и се изтласква през колоната под високо налягане от различни разтворители като вода, метанол или ацетонитрил. Различните концентрации на всеки разтворител ще повлияят по различен начин на хроматографията на всяко съединение. Ако пробата остане в течно състояние, това увеличава стабилността на съединението.
Колоните за газова хроматография имат много малък вътрешен диаметър и дължината им може да варира от 10 до 45 метра. Тези колони на основата на силициев диоксид се навиват по кръгла метална рамка и се нагряват до температура от 250 градуса по Фаренхайт. Колоните за течна хроматография също са на основата на силициев диоксид, но имат дебел метален корпус, за да издържат на големи количества вътрешно налягане. Тези колони работят при стайна температура и са с дължина от 50 до 250 сантиметра.
При газова хроматография, пробата, инжектирана в системата, се изпарява при около 400 градуса по Фаренхайт, преди да бъде пренесена през колоната. По този начин съединението трябва да може да издържа на топлина при високи температури, без да се разпада или разгражда в друга молекула. Течните хроматографски системи позволяват на учения да анализира по-големи и по-нестабилни съединения, тъй като пробата не е подложена на топлина.