Подобно на повечето биоми на Земята, екосистемата на савана оцелява при деликатен баланс между факторите на околната среда и различни видове, включително хората. Силната суша може да ограби тези тревни площи от животворната им вода и листа, докато бракониерите и коренното население често заплашва да наруши хранителната мрежа чрез убийството на животни за спорт или оцеляване.
Човешки дейности
Човешките дейности могат сериозно да заплашат да нарушат екосистемите на савана. Неустойчивото използване на вода и напоителните методи могат потенциално да изсъхнат животворните реки и водни дупки. В регионите, в които местното население редовно включва в храната си месо - диво месо, популациите на копитни животни намаляват със забележими темпове. Някои диви животни на савана също се ловуват като трофеи; по-специално черните носорози се ловят заради ценните им рога. Дори някои растителни видове са прекомерно събрани поради тяхната търговска стойност. Дърворезбите, направени от африканско черно дърво, саванско дърво, често се продават на туристическите пазари.
Суша и тежка паша
Продължителната, силна суша има опасен ефект върху екосистемата на савана, като пасищните модели изострят този ефект. Комбинацията от силна суша и паша може да промени пасища от предимно годни за консумация многогодишни треви до савана, доминирана от неядливи треви и растения. Леко пасещите тревни площи запазват качеството си на вкусни многогодишни тревни видове, но съставът на растителните видове все още може да бъде променен. Експертите призовават решенията за управление на пашата по време на епизодите на суша да повлияят на посоката на потенциалните промени към устойчивостта на пасищата.
Опустиняване
Тропическите савани често граничат със сухи, пустинни региони, а разпространението на подобни на пустиня условия в сухи тревни площи се нарича опустиняване. Тази заплаха за екосистемата на савана включва ефекти, причинени от изменението на климата, земеделски практики, прекомерна паша, агресивно напояване в селското стопанство, което намалява нивото на водната маса далеч от корените на растенията, обезлесяването и ерозия. Всяка година над 46 000 квадратни километра африканска савана става пустиня. Засаждането на устойчиви на суша растения може да стабилизира изместващите се пясъчни дюни и да започне разпространението на допълнителна растителност.
Въглеродни емисии
Проучване от 2012 г. отдава голямо увеличение на дървесната растителна маса на „ефекта на торене с CO2“. Авторите заяви, че увеличаването на скоростта на растеж на дървесни растения е причинено от увеличаване на атмосферния въглерод диоксид. Драматично увеличаване на количеството дървета и храсти може да застраши цялата екосистема на савана, тъй като тези растения използват повече вода, отколкото треви. Природозащитниците в Намибия съобщават, че дървесните растения пречат както на антилопа, така и на гепардите, които ги ловят - развитие, което може да има неизвестни последици в целия пасища.
