Вчені мають можливість секвенувати молекулу ДНК; іншими словами, вони можуть визначати порядок основ нуклеотидів у будь-якій даній молекулі. Секвенування молекули ДНК може бути першим із ряду етапів, необхідних для з'ясування того, як конкретно нуклеотиди в молекулі ДНК взаємодіють між собою і кодують різні характеристики в організм. Процес секвенування ДНК досить задіяний, але автоматичні ДНК-секвенсори мінімізують участь людини, необхідну принаймні для частини процесу.
Підготовка зразка
Щоб автоматичний секвенсор ДНК працював, він повинен виявити чотири нуклеотидні основи, з яких складається ДНК: аденін, гуанін, тимін та цитозин. Вчені багато разів копіюють шматок ДНК і використовують ферменти рестрикції, щоб розрізати ДНК на шматочки різного розміру. Потім вони додають невелику кількість флуоресцентно міченої основи до кожної партії ДНК. Основа, яка є аденином, тиміном, гуаніном або цитозином, зв’язуватиметься з основним комплементом на кінці нитки. Наприклад, аденін зв'язуватиметься з нитками, що закінчуються тиміном, а гуанін - з нитками, що закінчуються цитозином.
Побудова автоматичного секвенсора ДНК
Автоматичний ДНК-секвенсор побудований так само, як ДНК-секвенсор, що вимагає більшої ручної праці. Зокрема, автоматичний секвенсор ДНК - це резервуар довжиною близько 1 фута з 96 гелевими лунками, в які можна заливати ДНК. В автоматичному ДНК-секвенсорі, як і в будь-якому ДНК-секвенсорі, ДНК вводять у гелеві лунки у верхній частині резервуара, і негативний заряд прикладають до цього кінця резервуара. Негативний заряд забезпечує сильний стимул для ниток ДНК пройти різну відстань до кінця резервуара.
Автоматична ін’єкція
Автоматичний ДНК-секвенсор автоматично вводить партії ДНК у верхню частину гелю. Таким чином, це економить дослідникам надзвичайно багато часу та зусиль. Після того, як партії вводяться, секвенсор автоматично подає негативний заряд на один кінець бака, змушуючи нитки мігрувати на різну відстань через гель. Різні відстані відображають різні розміри ниток ДНК, що проходять через гель.
Детектор
Багато автоматичних машин для секвенування ДНК створені для виявлення флуоресцентного барвника на нитках ДНК, що проходять через гель. Роблячи це, вони можуть ідентифікувати нуклеотиди, що знаходяться на кінцях ниток, і записати їх у комп’ютер. Однак секвенсори, в кращому випадку, представляють змішану версію нуклеотидів ДНК. Після використання автоматичної машини для секвенування ДНК ви повинні пройти процес під назвою «обробка», в якому поєднується комп’ютер і дослідники сортують результати з виявлення ланцюга ДНК, щоб зібрати дані у всебічний опис ДНК пасмо. Не дивно, що цей процес може зайняти набагато більше часу, ніж фактичний процес послідовності.
