Хромосомний кросинговер, який також називають генетичним кросинговером, є нормальним процесом, за допомогою якого гени рекомбінують. Рекомбінація збільшує генетичні варіації шляхом рекомбінації з отриманням різних ознак.
TL; DR (занадто довгий; Не читав)
Втручання генів є мірою незалежності кросоверів один від одного. Якщо кросовер в одній області впливає на кросовер в іншій області, ця взаємодія називається інтерференцією. Втручання = 1 - c.o.c., де c.o.c. - коефіцієнт збігу (c.o.c.)
У людини 23 хромосоми. Під час мейозу одна клітина ділиться двічі, утворюючи чотири дочірні клітини. Ці чотири дочірні клітини мають половину кількості хромосом батьківської клітини. Потім вони можуть приєднатися до іншої хромосомної половини або від яйцеклітини, або від сперми, щоб стати цілою парою.
Іноді ці дві частини не залишаються разом. Якщо шматки зламаються, вони можуть з’єднатися з іншим розбитим шматочком. Дві генетичні копії, які рекомбінують, називаються хроматидами. Такі проблеми, як синдром Дауна чи інші генетичні розлади, можуть бути спричинені неправильним поєднанням генів.
Більшість кросоверів відбуваються нормально. Іноді трапляється подвійний кросовер. Це коли хроматиди з’єднуються в двох точках, а не в одній. У другій точці контакту хроматиди можуть знову розділитися і знову обмінюватися генетичною інформацією.
Втручання генів є мірою незалежності кросоверів один від одного. Іншими словами, оскільки ви знаєте, що трапляються подвійні кросовери, ви повинні відповісти на питання, чи є кросовери в сусідніх хромосомних регіонах незалежними чи ні. Якщо вони не незалежні, це означає, що кросовер в одному регіоні впливає на ймовірність наявності кросовера в сусідньому регіоні. Якщо кросовер в одній області впливає на кросовер в іншій області, ця взаємодія називається інтерференцією.
Як розрахувати перешкоди
Розглядаючи спосіб обчислення перешкод, першим кроком є обчислення коефіцієнта збігу (c.o.c.). C.o.c. у свою чергу залежить від ймовірності подвійного кросовера, що називається значенням частоти кросовера, також відомого як "частота подвійних рекомбінантів".
Коефіцієнт збігу - це відношення спостережуваних до очікуваних подвійних рекомбінантів.
Коефіцієнт збігу = частота спостережуваних подвійних рекомбінантів / частота очікуваних подвійних рекомбінантів
Очікувана кількість подвійних рекомбінантів у вибірці двох незалежних областей дорівнює добутку рекомбінантних частот у сусідніх областях.
Потім перешкоди визначаються наступним чином:
перешкоди = 1 - к.о.с.
Інтерференція говорить вам, наскільки сильно кросинговер в одній з областей ДНК перешкоджає утворенню кросовера в іншій області.
Якщо перешкоди дорівнюють нулю, це означає, що подвійні кросовери відбуваються, як передбачалося, і що кросовер в одній області відбувається незалежно від кросовера в сусідній області.
Якщо перешкоди дорівнюють 1, це означає, що перешкоди повні і що подвійних кросоверів немає спостерігається, оскільки кросовер в одній області виключає ймовірність кросовера в сусідній регіону.
Як правило, ваші дані будуть мати перешкоди від 0 до 1. Значення, що перевищують нуль, але нижче одиниці, вказують на наявність перешкод.