Протягом життєвих циклів насіння рослини перебувають у стані спокою до етапів проростання. У періоди спокою мало активності, оскільки насіння чекають належних умов навколишнього середовища для зростання. Як тільки починається проростання, швидкість клітинного дихання різко збільшується, щоб забезпечити необхідні матеріали для початкових стадій росту рослин.
Процеси клітинного дихання забезпечують клітинам спосіб перетворення існуючих поживних речовин в енергію. У періоди спокою насіння рослин дихають настільки, щоб забезпечити їжу або запаси поживних речовин в межах спеціалізованого шару насіння, відомого як ендосперм. У межах квітучих рослин структури ендосперму є продуктом подвійного процесу запліднення, який відбувається при першому заплідненні яйцеклітини рослини або зав’язі. По суті, ендосперм забезпечує потреби насіння в поживних речовинах і виконує необхідні функції клітинного дихання протягом усього періоду спокою. Початок проростання ставить значні потреби в енергії на насінні, коли формуються процеси росту рослин. Як результат, частота дихання клітин збільшується, щоб забезпечити клітинну діяльність, необхідну для розкриття насіння та утворення початкових корінних та стовбурових структур.
Насіння рослин походять з квітів, фруктів, зелених рослин і дерев, які ростуть у незліченних екологічних умовах. Не дивно, що кожен тип насіння шукає певні екологічні фактори, що спонукають до початку процесів проростання. Згідно з Університетом Корнелла, екологічні тригери можуть виглядати як підвищений рівень поживних речовин у ґрунту, зміни температури ґрунту, збільшення кількості опадів або збільшення кількості та якості світло. Після досягнення необхідних умов насіння починають збільшувати рівень водопоглинання, що знаменує початок сходів. Збільшення водопоглинання дозволяє насінню мобілізувати запаси їжі, що зберігаються в шарах ендосперму. Ці процеси активують певні ферменти, які викликають збільшення швидкості клітинного дихання насіння.
Проростаючі насіння здійснюють процеси клітинного дихання приблизно так само, як це роблять рослинні та тваринні клітини. Клітинне дихання проходить у три стадії, починаючи з гліколізу. На стадії гліколізу молекули глюкози виробляють дві одиниці енергії або молекули АТФ (аденозинтрифосфату) разом з іншими хімічними матеріалами. Цикл Кребса становить другу стадію клітинного дихання. Ця стадія використовує продукти гліколізу для отримання ще двох енергетичних одиниць і перетворює хімічні речовини, що залишилися від гліколізу, у молекули, що несуть водень. Електронно-транспортна ланцюг є третьою стадією в процесі дихання і підживлюється двома молекулами АТФ, що утворюються в циклі Кребса. Ця стадія поєднує енергію, що міститься всередині молекул водню з циклу Кребса, з киснем, створюючи 38 молекул АТФ. Цей триступеневий процес повторюється знову і знову в кожній окремій клітині рослини. Молекули АТФ, що виробляються клітинним диханням, забезпечують енергію для початку проростання насіння і підживлюють клітинно-будівельну діяльність, яка в кінцевому підсумку формує організм рослини.