ความแตกต่างของการสกัดดีเอ็นเอของจีโนมระหว่างสัตว์และพืช

โครงสร้างของ DNA ที่มีเกลียวคู่นั้นเป็นสากลในเซลล์ที่มีชีวิตทั้งหมด แต่มีความแตกต่างกันในวิธีการสกัดจีโนม DNA จากเซลล์สัตว์และพืช แม้ว่าจีโนม DNA จะอาศัยอยู่ในนิวเคลียสของเซลล์ แต่ปริมาณและความบริสุทธิ์ของ DNA ที่สกัดออกมานั้นขึ้นอยู่กับชนิดและขนาดของเซลล์ ตัวอย่างเช่น เซลล์บางชนิดมี DNA และสิ่งสกปรกมากกว่าเซลล์อื่นๆ อ่านเพื่อเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับความแตกต่างของการสกัดดีเอ็นเอ

หากคุณรักษาเซลล์พืชและสัตว์ด้วยสารสบู่ มันจะย่อยสลายไขมันในเซลล์และเยื่อหุ้มนิวเคลียส จากนั้นส่วนผสมของ DNA จะแยกออกจากเยื่อหุ้มเซลล์และโปรตีน ต่อไป คุณสามารถใช้แอลกอฮอล์เพื่อทำให้ DNA ตกตะกอนในสารละลายได้ ขึ้นอยู่กับปริมาณในตัวอย่าง ดีเอ็นเออาจมองเห็นได้ด้วยตาเปล่า อย่างไรก็ตาม พึงระลึกไว้เสมอว่าขั้นตอนง่ายๆ นี้ไม่ได้สร้าง DNA ที่มีความบริสุทธิ์สูงเสมอไป

เซลล์พืชแตกต่างจากเซลล์สัตว์เนื่องจากผนังเซลล์แข็งและออร์แกเนลล์เช่นคลอโรพลาสต์ พวกเขายังมีโปรตีนและเอนไซม์ที่มีบทบาทในการสังเคราะห์แสง เซลล์พืชบางชนิดมี polyploidy ซึ่งหมายความว่ามีโครโมโซมแต่ละชุดมากกว่าหนึ่งชุดต่อเซลล์ นอกจากนี้ กระบวนการระดับเซลล์ที่เกิดขึ้นในพืช เช่น การสังเคราะห์ด้วยแสงยังสร้างเมตาบอไลต์ทุติยภูมิอีกด้วย เซลล์สัตว์ไม่มีผนังเซลล์ แต่ยังต้องการสารเคมี เช่น โซเดียม โดเดซิล ซัลเฟต (SDS) เพื่อทำลายเยื่อหุ้มเซลล์เพื่อปล่อยจีโนมดีเอ็นเอ

จีโนม DNA ของพืชนั้นสกัดได้ยากกว่าเนื่องจากผนังเซลล์ของพืช คุณสามารถลบออกได้โดยการทำให้เป็นเนื้อเดียวกันหรือโดยการเพิ่มเซลลูเลสเพื่อทำให้เซลลูโลสที่ประกอบเป็นผนังเซลล์เสื่อมโทรม นอกจากนี้ เมแทบอไลต์ที่มีอยู่ในเซลล์พืชอาจรบกวนการสกัดจีโนมดีเอ็นเอโดยการปนเปื้อนตัวอย่างดีเอ็นเอในระหว่างกระบวนการตกตะกอน

เม็ดเลือดขาวในเลือดส่วนปลายเป็นแหล่งหลักของ DNA จีโนมของสัตว์ แต่การเก็บตัวอย่างทำได้ยากเพราะเลือดต้องมาจากสัตว์โดยตรง เลือดประกอบด้วยสารประกอบหลายชนิด เช่น โปรตีน ลิปิด เซลล์เม็ดเลือดขาว เซลล์เม็ดเลือดแดง เกล็ดเลือด และพลาสมา ซึ่งสามารถปนเปื้อนตัวอย่างดีเอ็นเอได้ อย่างไรก็ตาม สิ่งปนเปื้อนหลักของ DNA สัตว์ที่สกัดจากตัวอย่างเลือดคือ heme ซึ่งเป็นส่วนประกอบที่ไม่ใช่โปรตีนของเฮโมโกลบิน

ความแตกต่างระหว่าง DNA พืชและสัตว์อยู่ในลำดับเบสในเกลียว สารประกอบที่พบในเซลล์พืชไม่มีอยู่ในเซลล์สัตว์ และลำดับเบสของ DNA จะสะท้อนสิ่งนี้ นอกจากนี้ DNA ของพืชจีโนมมักจะมีขนาดใหญ่กว่า DNA ของสัตว์ ความแตกต่างเหล่านี้ส่งผลต่อวิธีการสกัด ผลผลิต และความบริสุทธิ์ของดีเอ็นเอด้วย