วิธีทำความเข้าใจผลลัพธ์ของ Flow Cytometry

นักวิทยาศาสตร์ใช้โฟลว์ไซโตเมทรีเพื่อแยกความแตกต่างระหว่างเซลล์ประเภทต่างๆ หรือสิ่งมีชีวิตขนาดเล็ก เป็นเครื่องมือที่ใช้ในการใช้งานหลายอย่าง เช่น การวินิจฉัยทางการแพทย์หรือพยาธิวิทยาทางนิติเวช แม้ว่าเทคนิคการทดลองนี้จะทำได้ค่อนข้างง่าย แต่การวิเคราะห์ข้อมูลที่ซับซ้อนที่สร้างขึ้น โดยโฟลว์ไซโตมิเตอร์นั้นยากกว่าเนื่องจากปัจจัยการทดลองหลายตัวและ/หรือไซโตมิเตอร์ พารามิเตอร์ ดังนั้นจึงเป็นกิจวัตรสำหรับการแสดงข้อมูลไซโตเมตริกและวิเคราะห์โดยใช้โปรแกรมระดับมืออาชีพที่มีความซับซ้อน เช่น CELLQuest หรือ FlowJo จำเป็นต้องคุ้นเคยกับเทคนิคโฟลว์ไซโตเมทรี เครื่องจักรและซอฟต์แวร์เพื่อทำความเข้าใจผลลัพธ์ที่เกิดจากสิ่งเหล่านี้ การทดลอง

ชี้แจงจุดมุ่งหมายของการทดลองโดยถามว่า "คำถามหรือสมมติฐานที่กำลังตรวจสอบคืออะไร" นี้จะเป็น จำเป็นต้องปรับผลลัพธ์ดิบให้อยู่ในรูปแบบและการตั้งค่าที่เหมาะสมสำหรับการวิเคราะห์ต่อไปโดยใช้ cytometry ทางสถิติ ซอฟต์แวร์. ทำการเปลี่ยนแปลงที่จำเป็นเพื่อให้ข้อมูลแสดงด้วยการตั้งค่าที่เกี่ยวข้อง (เช่น เซลล์บวก ประตูลบ ความเข้มของการเรืองแสง จำนวนเซลล์ ฯลฯ)

หาประตู. เซลล์สามารถจัดกลุ่มหรือสังเกตง่ายๆ ว่ารวมกลุ่มเข้าด้วยกันบนพล็อตความหนาแน่นหรือไดอะแกรมรูปร่าง กลุ่มมักจะแยกจากกันขึ้นอยู่กับตัวตนของพวกเขา ถ้ากลุ่มหนึ่งคราบอย่างเข้มข้นมากสำหรับมาร์กเกอร์หรือแอนติบอดีที่เจาะจง จะสรุปได้ว่าสมาชิกของกลุ่มนั้นล้วนมีเอกลักษณ์เฉพาะของชนิดเซลล์ที่จำเพาะ ซึ่งแสดงออกถึงเครื่องหมายนั้น เป็นเรื่องปกติที่จะพบเซลล์ที่เป็นค่าบวกสำหรับเครื่องหมายเหล่านี้มากกว่าหนึ่งตัว และเซลล์เหล่านี้มักจะเป็นเซลล์ระดับกลางและแสดงเป็น "ค่าบวกสองเท่า"

ดูสแกตเตอร์กราฟ วิธีที่กลุ่มเซลล์กระจายออกไปในแผนภาพแบบกระจายเป็นการบ่งชี้ขนาดของเซลล์ เซลล์ที่มีการกระจายขนาดใหญ่หรือสูงมากมักเป็นเซลล์ขนาดใหญ่ อย่างไรก็ตามอาจมีขนาดใหญ่เพียงเพราะมีไซโตพลาสซึมในสัดส่วนสูงหรืออาจสูงเพราะมีนิวเคลียสที่ใหญ่มาก แน่นอนว่าสิ่งนี้จะแตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับชีววิทยาที่กำลังตรวจสอบ

ดูตัวเลข. ปรับพล็อตเพื่อแสดงพารามิเตอร์ต่างๆ บนแกนเดียว (โดยปกติคือแกน X) ในขณะที่ยังคงนับบนแกน Y นี่ระบุสัดส่วนของประชากรกลุ่มตัวอย่างที่เป็นค่าบวกสำหรับพารามิเตอร์นั้น ๆ เช่น a ปกติจะสังเกตเห็นจุดสูงสุดในตัวอย่างที่มีสีเป็นบวก ซึ่งจะไม่อยู่ในกลุ่มควบคุมเชิงลบ ตัวอย่าง.

ดูฮิสโตแกรมหลายพารามิเตอร์ โดยการปรับแกน X และแกน Y ให้แต่ละแกนแทนค่าพารามิเตอร์ที่แตกต่างกันคือ ตรวจสอบระหว่างการทดลอง ทำให้สามารถเข้าใจคุณสมบัติต่างๆ ได้อย่างลึกซึ้งยิ่งขึ้น ของตัวอย่าง ตัวอย่างเช่น โดยการตั้งค่าแกน X เป็นแสงเรืองแสงสีแดง และแกน Y เป็นแสงเรืองแสงสีเขียว สามารถคำนวณเกทแบบควอแดรนต์สำหรับ ตัวอย่างเพื่อแสดงสี่ภูมิภาคของจตุภาคที่มีเซลล์อยู่และถูกย้อมสำหรับการเรืองแสงสีแดงหรือสีเขียว ทั้งสองสี หรือไม่มีเลยที่ ทั้งหมด. ซึ่งช่วยให้สามารถแบ่งตัวอย่างที่ต่างกันออกเป็นส่วนๆ ของมัน และเอนทิตีที่ทับซ้อนกันใดๆ ให้แสดงเป็นภาพและแสดงปริมาณได้

อ้างอิง

  • “การวิเคราะห์ข้อมูลโฟลว์ไซโตเมทรี”; ซูซานแชร์โรว์; 1991
  • “โฟลว์ไซโตเมทรี: เครื่องมือวัดและการวิเคราะห์ข้อมูล”; มาร์วิน แวน ดิลา; 1985
  • “ โปรโตคอลโฟลว์ไซโตเมทรี”; เทเรซาและโรเบิร์ต ฮอว์ลีย์; 2004

เกี่ยวกับผู้เขียน

Palmer Owyoung สำเร็จการศึกษาศิลปศาสตรมหาบัณฑิตสาขาธุรกิจระหว่างประเทศจาก University of California at San Diego และ a ศิลปศาสตรบัณฑิตสาขาสังคมวิทยาจากมหาวิทยาลัยแคลิฟอร์เนียที่ซานตาบาร์บาร่าและเป็นโมเลกุลที่ได้รับการฝึกอบรม นักชีววิทยา เขาเป็นนักเขียนอิสระมาตั้งแต่ปี 2549 นอกเหนือจากการเขียนแล้ว เขายังเป็นนักเทรด Forex เต็มเวลาและนักการตลาดทางอินเทอร์เน็ตอีกด้วย

เครดิตภาพ

รูปภาพ RF / Polka Dot / Getty ของ Polka Dot

  • แบ่งปัน
instagram viewer