วิธีการตีความ Agarose Gel

เมื่อคุณเรียกใช้ตัวอย่างดีเอ็นเอบนเจลอะกาโรสและถ่ายภาพแล้ว คุณสามารถบันทึกภาพไว้ดูในภายหลัง ซึ่งคุณสามารถวิเคราะห์ผลลัพธ์และตีความได้ ประเภทของสิ่งที่คุณกำลังมองหาจะขึ้นอยู่กับลักษณะของการทดสอบของคุณ ตัวอย่างเช่น หากคุณกำลังทำลายพิมพ์ดีเอ็นเอ คุณจะต้องเปรียบเทียบขนาดของชิ้นส่วนของดีเอ็นเอจากสองตัวอย่าง -- จากผู้ต้องสงสัยและจากตัวอย่างที่เกิดเหตุ หากคุณกำลังทำงานกับพลาสมิดจากแบคทีเรีย ในทางกลับกัน คุณอาจต้องตรวจสอบให้แน่ใจว่าพลาสมิดประกอบด้วยส่วนแทรก ดังนั้น วิธีการตีความเจลของคุณจะขึ้นอยู่กับการทดลองที่คุณทำ อย่างไรก็ตาม มีกฎทั่วไปบางประการที่คุณสามารถนำไปใช้ได้

โปรดทราบว่าคุณอาจหรือไม่จำเป็นต้องใช้คำแนะนำในหัวข้อนี้ มักใช้ Agarose gel electrophoresis เพื่อยืนยันว่าพลาสมิดมีเม็ดมีดที่ให้มา หากคุณไม่ได้ใช้งานพลาสมิด คุณสามารถข้ามส่วนนี้ได้ อย่างไรก็ตาม หากคุณเป็นเช่นนั้น คุณสามารถปฏิบัติตามคำแนะนำเหล่านี้ได้

โปรดสังเกตว่า หากคุณกำลังทำงานกับพลาสมิดที่ไม่ได้เจียระไนหรือแบบเจาะ คุณไม่สามารถประมาณขนาดโดยใช้ขั้นตอนจากส่วนที่ 1 ด้านบนได้ นั่นเป็นเพราะพลาสมิดที่ไม่ได้เจียระไนและพลาสมิดที่แยกออกมาในอัตราที่ต่างกันจาก DNA เชิงเส้น

เปรียบเทียบจำนวนแบนด์ในแต่ละเลน จำได้ว่าเอ็นไซม์จำกัดตัด DNA ที่ไซต์ซึ่งมีลำดับที่เรียกว่าไซต์จำกัดเกิดขึ้น หากตัวอย่างได้รับการบำบัดด้วยเอ็นไซม์ควบคุม 2 ตัว ควรมีแถบสำหรับเม็ดมีดและแถบสำหรับส่วนที่เหลือของพลาสมิด นั่นเป็นเพราะว่าเม็ดมีดจะถูกขนาบข้างด้วยไซต์จำกัดสองแห่ง แต่ละไซต์สำหรับเอ็นไซม์ที่ต่างกัน ดังนั้นการตัดที่ไซต์ทั้งสองนี้จะทำให้เม็ดมีดหลุดออกจากพลาสมิด ในทางตรงกันข้าม การตัดที่ไซต์เดียวจะเปลี่ยนพลาสมิดเป็น DNA เชิงเส้น ตัวอย่างที่ตัดโดยไม่มีเอ็นไซม์จำกัดหรือเอ็นไซม์จำกัดหนึ่งเอ็นไซม์ ควรมีแถบเดียว ในขณะที่ตัวอย่างที่มีเอ็นไซม์จำกัดสองตัวควรมีแถบสองแถบ

มองหาแถบที่สร้างขึ้นโดย nicked plasmid DNA พลาสมิดที่มีผิวเผินมีบาดแผลเพียงเส้นเดียวเท่านั้น ดังนั้นมันจึงอพยพได้ช้ากว่าพลาสมิดที่ถูกตัดออก พลาสมิดที่ตัดแล้วจะอพยพช้ากว่า DNA ที่ไม่ได้เจียระไน

ประเมินขนาดของเม็ดมีดโดยใช้ขั้นตอนที่อธิบายไว้ในส่วนที่ 1 และพิจารณาว่าตรงกับความคาดหวังของคุณหรือไม่ (ซึ่งจะแตกต่างกันไปตามการทดสอบ)

สิ่งที่คุณต้องการ

  • ดินสอ
  • กระดาษ
  • โปรแกรมสเปรดชีต
  • รูปภาพของเจลของคุณ
  • ไม้บรรทัด
  • แบ่งปัน
instagram viewer