จุลชีววิทยาคือการศึกษาสิ่งมีชีวิตที่มีขนาดเล็กเกินกว่าจะมองเห็นได้ด้วยตาเปล่า จุลชีววิทยาสามารถจำแนกได้หลายวิธี เนื่องจากเหมาะสมกับการศึกษาสิ่งมีชีวิตที่มีจำนวนมากกว่าสิ่งมีชีวิตหลายเซลล์ จุลชีววิทยาสามารถเข้าถึงได้โดยการศึกษาการแบ่งอนุกรมวิธานต่างๆ หรือแบ่งตามกลุ่มของสิ่งมีชีวิตที่อยู่ระหว่างการศึกษา จุลชีววิทยาสามารถคิดได้ว่าเป็นชุดของสาขาวิชาต่าง ๆ หรือสามารถแยกออกได้โดยพิจารณาจากกิจกรรมต่าง ๆ ที่นักจุลชีววิทยาดำเนินการ
ดิวิชั่น
นักชีววิทยาได้จำแนกสิ่งมีชีวิตทั้งหมดบนโลกให้เป็นหนึ่งในสามกลุ่มอนุกรมวิธานขนาดใหญ่ที่เรียกว่าโดเมน: อาร์เคีย แบคทีเรีย และยูคาริยา อาร์เคียและแบคทีเรียเป็นโปรคาริโอต ซึ่งเป็นสิ่งมีชีวิตที่เซลล์ไม่มีนิวเคลียสตรงกลาง ล้วนเป็นสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียว โดยทั่วไปแล้วแบคทีเรียจะมีความแตกต่างจากโครงสร้างที่มีลักษณะเฉพาะในเปลือกนอกของพวกมัน นั่นคือ ผนังเซลล์ที่สร้างจากโมเลกุลที่เรียกว่าเปปติโดไกลแคน Archaea นั้นคล้ายกับแบคทีเรีย ยกเว้นว่าชีวเคมีภายในของพวกมันทำงานตามกฎที่แตกต่างกัน และพวกมันส่วนใหญ่ถูกปรับให้เข้ากับสภาพแวดล้อมที่รุนแรง ยูคาเรียมีลักษณะเป็นเซลล์ที่มีนิวเคลียสและโครงสร้างภายในที่เป็นเอกลักษณ์อื่นๆ ในเซลล์ แม้ว่ายูคาริโอตจำนวนมากจะเป็นสิ่งมีชีวิตขนาดใหญ่ เช่น ช้าง ต้นเรดวูด และมนุษย์ แต่สปีชีส์ยูคาริโอตส่วนใหญ่เป็นจุลินทรีย์เซลล์เดียว
กลุ่ม
อีกวิธีหนึ่งในการแบ่งการศึกษาจุลชีววิทยาคือโดยทุกกลุ่มของสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียว สิ่งนี้ละเลยระดับอนุกรมวิธานของสิ่งมีชีวิตและโดยพื้นฐานแล้วถือว่าหน่วยงานทั้งหมดที่อยู่ภายใต้ขนาดที่แน่นอนจะอยู่ภายใต้ร่มของจุลชีววิทยา ซึ่งรวมถึงแบคทีเรียและอาร์เคียซึ่งเป็นโดเมน และเชื้อรา สาหร่ายและโปรโตซัวซึ่งเป็นอาณาจักรภายในโดเมนของยูคาเรีย นอกจากนี้ยังรวมถึงไวรัสซึ่งไม่อยู่ในการจำแนกประเภทของสิ่งมีชีวิต
เชื้อรารวมถึงราและยีสต์ สาหร่ายเป็นพืชเซลล์เดียวที่ทำให้พื้นผิวของสระน้ำเป็นสีเขียวหรือสีเหลือง โปรโตซัวเป็นเหมือนสัตว์เซลล์เดียว พวกมันเคลื่อนที่ได้ง่ายกว่าสาหร่ายหรือเชื้อรา ไวรัสเป็นกลุ่มของสิ่งมีชีวิตที่แตกต่างไปจากเดิมอย่างสิ้นเชิงที่ข้ามเส้นแบ่งระหว่างสิ่งมีชีวิตกับไม่มีชีวิต แต่การศึกษาของพวกมันยังอยู่ภายใต้ร่มของจุลชีววิทยา
วินัย
จุลชีววิทยาสามารถจำแนกได้ตามสาขาวิชาที่ศึกษาด้านจุลชีววิทยา ตัวอย่างเช่น นักภูมิคุ้มกันวิทยาศึกษากลไกการเกิดโรคของมนุษย์ที่เกิดจากการติดเชื้อจาก แบคทีเรีย เชื้อรา ไวรัส หรือโปรโตซัว ในขณะที่นักระบาดวิทยาศึกษาวิธีการติดเชื้อ ส่ง นักจุลชีววิทยาด้านอาหารและการเกษตรศึกษาวิธีที่เชื้อราหรือแบคทีเรียสามารถนำมาใช้ในการผลิตอาหาร ควบคู่ไปกับกลไกที่จุลินทรีย์สามารถทำลายพืชผลได้ นักเทคโนโลยีชีวภาพแสวงหาวิธีการใช้จุลินทรีย์ในการผลิตวัสดุที่มนุษย์ใช้
กิจกรรม
นักจุลชีววิทยาดำเนินกิจกรรมที่หลากหลายในระหว่างการศึกษาเอนทิตีด้วยกล้องจุลทรรศน์ และจุลชีววิทยาสามารถจำแนกตามกิจกรรมเหล่านี้ได้ เหล่านี้จัดเป็นกลุ่มที่สะดวกเรียกว่า "ฉัน" หกตัว "ฉัน" ทั้งหกเหล่านี้สามารถแสดงเป็นการฉีดวัคซีน การฟักไข่ การแยกตัว การตรวจสอบ การสอบสวน และการระบุตัวตน หมายถึงกระบวนการเพาะเลี้ยง สุ่มตัวอย่าง การสังเกตและทดสอบจุลินทรีย์