ตัวอย่างของอาร์คีแบคทีเรียที่มีชื่อวิทยาศาสตร์และการจำแนกประเภท

อาร์คีแบคทีเรียเป็นสิ่งมีชีวิตที่จริง ๆ แล้วมีความแตกต่างทางชีวเคมีและพันธุกรรมอย่างมากจากแบคทีเรียชนิดอื่น ดังนั้น อาร์คีแบคทีเรียจึงเป็นคำที่ล้าสมัย และตอนนี้พวกมันถูกจัดอยู่ในโดเมนอาร์เคีย การจำแนกประเภทภายในโดเมนนี้ไม่เป็นทางการเนื่องจากมีการถกเถียงกันเรื่องการสืบเชื้อสายของจุลินทรีย์ หลายคนอาศัยอยู่ในอุณหภูมิสุดขั้วของปล่องไฮโดรเทอร์มอลที่อยู่ลึกลงไปในมหาสมุทรหรือในบ่อน้ำพุร้อน และบางคนอาศัยอยู่ในโคลนที่ขาดออกซิเจน บางชนิดอาศัยอยู่ในน้ำที่มีความเค็มมาก และบางชนิดก็อาศัยอยู่ในสภาพแวดล้อมที่เป็นด่างหรือเป็นกรดที่รุนแรง หรือแม้แต่ในน้ำมัน ตัวอย่างต่อไปนี้จำแนกตามการจัดหมวดหมู่ของอาณาจักร ไฟลัม คลาส ลำดับ ครอบครัว สกุล และสปีชีส์

ตัวอย่างหนึ่งในโดเมน Archaea คือ Methanocaldococcus jannaschiiปัจจุบันจัดอยู่ในประเภท Archaea: Euryarchaeota: Methanobacteria; เมทาโนแบคทีเรีย: Methanobacteriaceae, Methanocaldococcus และสปีชีส์ jannaschii ได้มาจากปล่องไฮโดรเทอร์มอลบนพื้นมหาสมุทรซึ่งอาศัยอยู่ที่ความดันบรรยากาศมากกว่า 200 บรรยากาศและอุณหภูมิสูงกว่า 85 องศาเซลเซียส มันดำรงอยู่ได้โดยปราศจากออกซิเจนและผลิตก๊าซมีเทนเป็นผลจากการเผาผลาญของมัน

Methanibrevibacter smithii ปัจจุบันจัดเป็น Archaea; ยูรีอาร์เคโอตา; เมทาโนแบคทีเรีย; เมทาโนแบคทีเรีย; Methanobacteriaceae; เมทาโนเบรวิแบคเตอร์ และสปีชีส์สมิททิอิ มันกินเนื้อที่ลำไส้ของมนุษย์และทำงานโดยไม่มีออกซิเจน มันแปลงCO₂ ให้เป็นก๊าซมีเทนและมีความสำคัญในการสลายสารอาหาร

Haloquadra walsbyi กำลังจัดประเภท Archaea; ยูรีอาร์เคโอตา; ฮาโลแบคทีเรีย; ฮาโลแบคทีเรีย; Halobacteriaceae; ฮาโลควอดราตัม; และพันธุ์วอลส์บี มันอาศัยอยู่ในสภาพแวดล้อมที่มีความเค็มมากและใช้พลังงานจากดวงอาทิตย์ในกระบวนการสังเคราะห์แสง พวกมันเป็นรูปสี่เหลี่ยมจัตุรัสและมีถุงบรรจุก๊าซที่ช่วยให้พวกมันลอยได้ พวกเขายังสามารถเชื่อมโยงกันและสร้างแผ่นงานขนาดใหญ่ได้

Thermococcus litoralis เป็นอีกสายพันธุ์หนึ่งของช่องระบายความร้อนใต้ทะเลลึก ปัจจุบันจัดอยู่ในประเภท Archaea; ยูรีอาร์เคโอตา; เทอร์โมค็อกซี; เทอร์โมค็อกคาเค; เทอร์โมค็อกคัส; และสายพันธุ์ litoralis ต้องใช้กำมะถันจึงจะเติบโตได้ และไม่ผลิตก๊าซมีเทนไม่เหมือนตัวอย่างอื่นๆ มันเติบโตได้ดีในอุณหภูมิสูงและเป็นหนึ่งในอาร์เคีย รวมทั้งสายพันธุ์ที่ยังไม่ถูกค้นพบ

Nanoarchaeum equitans เป็นสมาชิกเพียงคนเดียวของคลาสย่อย Nanoarchaeota ของ Archaea นักวิทยาศาสตร์พบว่ามันอาศัยอยู่บนผนังเซลล์ของสิ่งมีชีวิตใหม่ อิกนิคอคคัส ชนิดที่พบในก้นมหาสมุทร ใกล้ช่องระบายความร้อน และในบ่อน้ำพุร้อนที่ตั้งอยู่ในอุทยานแห่งชาติเยลโลว์สโตน Nanoarchaeum equitansซึ่งดูเหมือนจะมีความสัมพันธ์แบบปรสิตกับ อิกนิคอคคัส สปีชีส์มีขนาดเล็ก มีเส้นผ่านศูนย์กลางเพียง 400 นาโนเมตร และดูเหมือนว่าจะเจริญเติบโตได้ในอุณหภูมิระหว่าง 167 ถึง 204 องศาฟาเรนไฮต์