ไนโตรเจนเป็นองค์ประกอบที่พบในโปรตีนทั้งหมด และจำเป็นต่อชีวิตพืชและสัตว์ ก๊าซไนโตรเจนในอากาศจะต้องถูกตรึงอยู่ในสารประกอบ ไม่ว่าจะโดยฟ้าผ่าหรือโดยแบคทีเรียที่อาศัยอยู่ในดิน ก่อนที่พืชจะนำไปใช้ได้ สารประกอบเหล่านี้รวมถึงแอมโมเนียและไนเตรต สัตว์สามารถนำไนโตรเจนเข้าไปได้โดยการกินพืช เมื่อสิ่งมีชีวิตตายหรือของเสียที่มีไนโตรเจนถูกขับออกมา แบคทีเรียและเชื้อราจะเปลี่ยนไนโตรเจนอินทรีย์กลับเป็นแอมโมเนีย
แบคทีเรียไนโตรแบคเตอร์
แบคทีเรียในดินที่เปลี่ยนไนไตรต์เป็นไนเตรตทั้งหมดอยู่ในสกุลไนโตรแบคเตอร์ มีสี่สายพันธุ์ที่ระบุ: Nitrobacter winogradskyi, Nitrobacter hamburgensis, Nitrobacter agilis และ Nitrobacter alkalicus ในปี 2550 การศึกษาสายวิวัฒนาการของสกุล Nitrobacter ซึ่งตีพิมพ์ใน "จุลชีววิทยาเชิงระบบและประยุกต์" ระบุ 30 สายพันธุ์ที่แตกต่างกันสำหรับบางชนิด ไนโตรแบคเตอร์มีอยู่ในดินและน้ำจืดที่ pH อยู่ในระดับปานกลาง ไม่เติบโตในแหล่งที่อยู่อาศัยที่มีความเป็นกรดสูง
แบคทีเรียไนโตรโซโมแนส
แบคทีเรียไนโตรแบคเตอร์มักเกิดขึ้นพร้อมกับแบคทีเรียจากสกุล Nitrosomonas ในชุมชนแบคทีเรียผสมที่เรียกว่าสมาคม แบคทีเรียทั้งสองชนิดเป็น codependent เนื่องจาก Nitrosomonas ผลิตไนไตรต์ที่ Nitrobacter ความต้องการ และ Nitrobacter จะทำความสะอาดไนไตรต์ที่สามารถยับยั้ง Nitrosomonas หากได้รับอนุญาตให้สร้าง ขึ้น
แบคทีเรียในทะเล
ในมหาสมุทร มีแบคทีเรียเพิ่มเติมอีก 2 ชนิดที่ออกซิไดซ์ไนไตรต์ให้เป็นไนเตรต ได้แก่ Nitrococcus mobilis และ Nitrospina gracilis Nitrococcus mobilis ซึ่งแยกได้จากน่านน้ำแปซิฟิกตอนใต้ เป็นค็อกคัสเคลื่อนที่ขนาดใหญ่ที่มีเยื่อหุ้มเซลล์รูปท่อที่มีลักษณะเฉพาะ Nitrospina gracilis นั้นยาว เรียว และมีรูปร่างเป็นแท่ง โดยไม่มีระบบเยื่อหุ้มเซลล์ที่กว้างขวาง Nitrospina มีวางจำหน่ายทั่วไปสำหรับผู้ที่ดูแลตู้ปลาน้ำเค็ม เพื่อช่วยในการรักษาระดับไนเตรตในน้ำในถัง แบคทีเรียช่วยออกซิไดซ์ไนไตรท์ที่เป็นพิษที่ปลาผลิต