ในปี ค.ศ. 1800 Gregor Mendel ทำนายว่ายีนทำงานอย่างไรเพื่อถ่ายทอดลักษณะทางกายภาพไปยังลูกหลานและคำนวณความน่าจะเป็นของลักษณะบางอย่างที่สืบทอดมา แม้ว่านักวิทยาศาสตร์จะไม่ได้ค้นพบการมีอยู่ของยีนจนกระทั่งในเวลาต่อมา หลักการพื้นฐานของเมนเดลก็ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าถูกต้อง Reginald Punnett พัฒนาจัตุรัส Punnett เป็นวิธีแบบกราฟิกเพื่อคำนวณความน่าจะเป็นของการสืบทอดตามหลักการของ Mendel คุณไม่จำเป็นต้องเข้าใจสถิติและความน่าจะเป็นในการคำนวณด้วยสี่เหลี่ยมจัตุรัส Punnett เพียงสร้างสี่เหลี่ยมจัตุรัสและสังเกตผลลัพธ์เพื่อกำหนดความน่าจะเป็นของลูกหลานที่สืบทอดลักษณะเฉพาะ
เขียนจีโนไทป์ของพาเรนต์หนึ่งคนเหนือสี่เหลี่ยม โดยใช้อักษรตัวพิมพ์ใหญ่สำหรับอัลลีลที่เด่นๆ และอักษรตัวพิมพ์เล็กสำหรับอัลลีลแบบถอย เขียนอัลลีลหนึ่งอัลลีลเหนือกล่องด้านซ้ายและอีกอัลลีลทับกล่องด้านขวา ลองพิจารณาตัวอย่างของสี่เหลี่ยมจัตุรัส Punnett สำหรับสีตาที่มีดวงตาสีน้ำตาลโดดเด่นและดวงตาสีฟ้าดูด้อย หากพาเรนต์มีจีโนไทป์ที่มีอัลลีลเด่นหนึ่งอันและอัลลีลด้อยหนึ่งอัน ให้เขียน "B" เหนือกล่องหนึ่งสำหรับอัลลีลที่เด่นและ "b" เหนือกล่องอื่นสำหรับอัลลีลแบบถอย
เขียนจีโนไทป์ของพาเรนต์อื่นทางด้านซ้ายของสี่เหลี่ยม วางอัลลีลหนึ่งอันไว้ทางด้านซ้ายของกล่องด้านบน และอีกอัลลีลหนึ่งอันทางด้านซ้ายของกล่องด้านล่าง ถ้าจีโนไทป์มีอัลลีลถอยสองอัลลีล เช่น เขียน "b" ข้างแต่ละช่อง
กรอกข้อมูลในแต่ละช่องด้วยอัลลีลที่เขียนด้านบนและด้านซ้าย หากช่องด้านซ้ายบนมี "B" อยู่ด้านบน และ "b" อยู่ทางซ้าย เช่น ให้เขียน "Bb" ลงในช่อง หากช่องขวาบนมี "b" อยู่ด้านบน และ "b" อยู่ทางซ้าย ให้เขียน "bb" ลงในช่อง ทำเช่นเดียวกันกับกล่องสองกล่องด้านล่าง
นับจำนวนกล่องที่มีอัลลีลเด่นอย่างน้อยหนึ่งกล่อง ในกรณีของพาเรนต์หนึ่งรายที่มีจีโนไทป์ Bb และผู้ปกครองหนึ่งรายที่มีจีโนไทป์ bb กล่องดังกล่าวจะมี Bb, bb, Bb และ bb กล่องสองกล่องในกรณีนี้มีอัลลีลที่โดดเด่น
หารจำนวนกล่องที่มีอัลลีลเด่นด้วยสี่แล้วคูณผลลัพธ์ด้วย 100 เพื่อให้ได้เปอร์เซ็นต์โอกาสที่ลูกหลานจะมีลักษณะเด่น ตัวอย่างเช่น (2/4)*100 = 50 จึงมีโอกาส 50 เปอร์เซ็นต์ที่ลูกหลานจะมีตาสีน้ำตาล
ลบเปอร์เซ็นต์โอกาสสำหรับลักษณะเด่นออกจาก 100 เพื่อรับเปอร์เซ็นต์โอกาสที่ลูกหลานจะแสดงลักษณะด้อย ตัวอย่างเช่น 100 - 50 = 50 ดังนั้นจึงมีโอกาส 50 เปอร์เซ็นต์ที่ลูกหลานจะมีตาสีฟ้า