แก๊สโครมาโตกราฟี (GC) ที่พัฒนาขึ้นในช่วงต้นศตวรรษที่ 20 เป็นวิธีการที่ใช้ในการแยกและวิเคราะห์ส่วนประกอบของสารผสม โดยเฉพาะอย่างยิ่งของผสมของของเหลวระเหยง่าย เช่น เบนซิน การแยกนี้ทำได้โดยการทำให้ส่วนผสมกลายเป็นไอก่อน จากนั้นจึงใช้แมสสเปกโตรมิเตอร์ที่ติดอยู่กับหน่วยโครมาโตกราฟีเพื่อระบุสารประกอบภายในส่วนผสมอย่างเหมาะสม
หลังจากที่ตัวอย่างถูกฉีดเข้าไปในเครื่องโครมาโตกราฟี ส่วนผสมจะถูกทำให้ระเหยและส่วนประกอบจะถูกส่งผ่านท่อด้วยก๊าซเฉื่อย ในหลอด ส่วนประกอบที่ระเหยกลายเป็นไอผ่านของเหลวหรือเฟสคงที่ภายในหลอด เฟสคงที่ใช้เพื่อยับยั้งก๊าซไม่ให้ผ่านคอลัมน์อย่างสมบูรณ์ ยิ่งส่วนประกอบผันผวนมากเท่าไร ส่วนประกอบก็จะยิ่งโต้ตอบกับเฟสที่อยู่กับที่น้อยลงเท่านั้น ดังนั้น ยิ่งก๊าซผ่านท่อได้เร็วเท่าไร -- ก็ยิ่งระเหยได้มากเท่านั้น)
ที่ปลายอีกด้านของท่อจะมีเครื่องตรวจจับที่ออกแบบมาเพื่อตรวจจับส่วนประกอบแต่ละส่วนของส่วนผสม เมื่อสารประกอบออกจากท่อ เครื่องตรวจจับสามารถวัดปริมาณได้โดยใช้วิธีการใดวิธีหนึ่งจากหลายวิธี เครื่องตรวจจับบางชนิดใช้เปลวไฟในการเผาตัวอย่าง ทำให้เกิดไอออน ไอออนเหล่านี้ตรวจพบโดยการวัดค่าการนำไฟฟ้าของเปลวไฟ เครื่องตรวจจับอีกประเภทหนึ่งจะวัดการมีอยู่ของตัวอย่างที่ระเหยโดยการเปลี่ยนแปลงค่าการนำไฟฟ้าของก๊าซพาหะ
ข้อมูลที่ส่งออกจากเครื่องตรวจจับจะปรากฏเป็นกราฟเส้น โดยแสดงปริมาณสารประกอบที่ตรวจพบตามเวลา สารประกอบที่ระเหยง่ายที่สุดจะปรากฏเป็นจุดสูงสุดบนกราฟก่อน พีคที่ตามมาบนกราฟแสดงถึงส่วนประกอบที่มีความผันผวนน้อยลงของส่วนผสมดั้งเดิม นักวิทยาศาสตร์สามารถใช้โครมาโตแกรมเหล่านี้เพื่อสลายคุณสมบัติทางเคมีของตัวอย่างต่อไปได้ ของผสม โดยสัดส่วนของขนาดพีคสัมพันธ์กับปริมาณของสารใน ตัวอย่าง. นักวิทยาศาสตร์ใช้พื้นที่ใต้ยอดเขาเพื่อกำหนดขนาด
แมสสเปกโตรมิเตอร์มีประโยชน์อย่างยิ่งเมื่อวิเคราะห์องค์ประกอบของส่วนผสมที่ไม่รู้จัก หน่วย gas chromatography-mass spectrometry (gc-ms) ที่รวมกันจะสแกนมวลของส่วนประกอบขณะที่เคลื่อนออกจากหลอด แมสสเปกโตรมิเตอร์จะยิงอิเล็กตรอนที่มีพลังไปที่ตัวอย่างที่ระเหยกลายเป็นไอ ซึ่งทำให้โมเลกุลของไอออไนซ์ จากนั้นเครื่องวิเคราะห์จะจัดเรียงไอออนโดยใช้อัตราส่วนมวลต่อประจุ หน่วย gc-ms ที่รวมกันนั้นเหมาะสมที่สุด เนื่องจากสามารถระบุมวลของส่วนประกอบได้ทันที และสามารถระบุส่วนประกอบที่ไม่ได้แยกจากกันโดยสิ้นเชิง