น้ำที่ใช้ในบ้าน ธุรกิจ และอุตสาหกรรมมักจะได้รับการบำบัดด้วยกระบวนการทางเคมีเพื่อกำจัดสารและแบคทีเรียที่เป็นอันตราย เมื่อน้ำได้รับการบำบัดทางเคมีแล้ว ก็สามารถนำกลับมาใช้ใหม่ได้อย่างปลอดภัยในแหล่งน้ำ สามารถใช้สารเคมีหลายชนิดในการบำบัดน้ำ เช่น คลอรีน มะนาว และไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ แต่ละวิธีมีข้อดีและข้อเสียที่แตกต่างกันสำหรับใช้ในการบำบัดน้ำ
คลอรีน
ตามประกาศของสภาคุณภาพน้ำและสุขภาพ ก่อนการใช้น้ำดื่มคลอรีนที่จุดเปลี่ยนของ ศตวรรษ โรคที่เกิดจากน้ำ เช่น อหิวาตกโรค ไข้ไทฟอยด์ โรคบิด และไวรัสตับอักเสบ ทำให้ชาวอเมริกันเสียชีวิตหลายพันคน ปี. ทุกวันนี้ คลอรีนยังคงเป็นวิธีการฆ่าเชื้อที่ใช้กันทั่วไปในน้ำดื่มและสระว่ายน้ำสาธารณะ คลอรีนไม่เพียงช่วยป้องกันการแพร่กระจายของการติดเชื้อเช่น E. โคไลยังทำลายแบคทีเรีย สาหร่าย และเชื้อราที่สามารถเติบโตบนผนังของระบบกักเก็บน้ำ และขจัดรสชาติและกลิ่นอันไม่พึงประสงค์จากน้ำดื่ม แม้ว่าคลอรีนจะมีประสิทธิภาพในการฆ่าเชื้อน้ำดื่ม แต่ก็สามารถจัดการได้ยากหากไม่มีผู้เชี่ยวชาญและประสบการณ์ คลอรีนในน้ำที่ใช้อาบน้ำ ซักผ้า และว่ายน้ำอาจทำให้ผิวหนังและเส้นผมแห้ง อาจทำให้เกิดอาการระคายเคืองต่อดวงตาและอาจทำให้ผ้าซีดจางได้
มะนาว
น้ำกระด้างมีแร่ธาตุที่ละลายน้ำได้ในระดับสูง ซึ่งสามารถสะสมในท่อน้ำและระบบภายในทำให้เกิดสิ่งกีดขวางและเสียหายถาวรได้ น้ำยาปรับสภาพน้ำที่ทำจากปูนขาวสามารถบำบัดคุณภาพน้ำเพื่อปรับปรุงน้ำกระด้างและลดระดับของสารหนูที่เป็นพิษในน้ำดื่ม มะนาวยังเปลี่ยนค่า pH ของน้ำและทำงานเพื่อทำลายสิ่งแวดล้อมที่จำเป็นสำหรับการเจริญเติบโตของแบคทีเรียและไวรัส ในบางกรณี ระดับ pH จะสูงเกินไปเมื่อทำให้มะนาวอ่อนตัวลง เมื่อเติมปูนขาวลงในน้ำคลอรีน ทำให้เกิดไฮโปคลอไรท์เป็นสารฆ่าเชื้อที่ด้อยกว่าคลอรีนตกค้างอื่นๆ
ไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์
ไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์เป็นสารฟอกสีที่ใช้เพื่อทำให้ฟันขาวขึ้น ทำให้สีผมสว่างขึ้น ผ้าฟอกและสิ่งทอ นอกจากนี้ยังสามารถใช้ในการฆ่าเชื้อในน้ำโดยการกำจัดมลพิษและยับยั้งการเจริญเติบโตของสารแบคทีเรีย โดยทั่วไปแล้ว ไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ถือว่าปลอดภัย ไม่ก่อให้เกิดสารตกค้างหรือก๊าซ และสามารถใช้เพื่อกำจัดคลอรีนที่ตกค้างจากคลอรีนได้ สารต้องขนส่งและจัดการด้วยความระมัดระวัง เนื่องจากการสัมผัสกับไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์อาจทำให้เกิดการระคายเคืองต่อดวงตา ผิวหนัง ปอด และเยื่อเมือก นอกจากนี้ Lenntech ยังตั้งข้อสังเกตว่าการศึกษาที่ดำเนินการโดยหน่วยงาน American International Agency on Cancer Research ระบุว่าการได้รับไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ในระดับสูงสามารถก่อมะเร็งในสัตว์ได้