แม่น้ำมิสซิสซิปปี้เป็นที่ตั้งของพืชน้ำและสัตว์น้ำหลากหลายชนิดในระบบนิเวศที่ซับซ้อนและเชื่อมโยงถึงกัน พืชน้ำเป็นแหล่งอาหารและที่พักพิงของสัตว์น้ำหลายชนิดในแม่น้ำ และอาจมีขนาดเล็กพอๆ กับสาหร่ายเซลล์เดียว แม่น้ำมิสซิสซิปปี้มีสัตว์หลายชนิดตั้งแต่สัตว์ไม่มีกระดูกสันหลังไปจนถึงปลา กบ และอื่นๆ
สาหร่าย
ตามที่กรมทรัพยากรธรรมชาติไอโอวา มิสซิสซิปปี้เป็นเจ้าภาพของสาหร่ายสองประเภทหลัก: สีเขียวและสีน้ำเงินสีเขียว สาหร่ายสีเขียวเป็นองค์ประกอบทางชีววิทยาพื้นฐานของระบบนิเวศที่สมบูรณ์ พวกเขาสร้างอาณานิคมขนาดใหญ่ที่สามารถให้น้ำเป็นสีเขียว สาหร่ายสีเขียวแกมน้ำเงินเป็นที่ต้องการน้อยกว่าและถือเป็นสาหร่ายที่ก่อความรำคาญ พวกมันเกี่ยวข้องกับระบบนิเวศที่ตึงเครียดและอาจทำให้เกิดรสชาติที่ไม่พึงประสงค์ในปลาหรือฆ่าประชากรทั้งหมด
แหน
พืชลอยน้ำทั่วไปนี้มีใบและรากเล็กๆ เพียงใบเดียวที่ห้อยอยู่ในน้ำเพื่อดูดสารอาหาร ตามชื่อที่ระบุไว้ แหนเป็นแหล่งอาหารที่สำคัญสำหรับนกน้ำหลายชนิด
ดอกบัว
ดอกบัวสีขาวเป็นถิ่นที่อยู่ทั่วไปในแม่น้ำมิสซิสซิปปี้ และประกอบด้วยใบไม้ลอยน้ำขนาดใหญ่ที่มีผิวสัมผัสคล้ายหนัง พวกมันผลิตดอกไม้สีขาวขนาดใหญ่บนใบและหยั่งรากในโคลนด้านล่าง
กั้ง
เรียกอีกอย่างว่ากุ้งน้ำจืดหรือกุ้งครัสเตเชียนกุ้งเหล่านี้มีลักษณะคล้ายกุ้งก้ามกรามขนาดเล็ก ส่วนใหญ่เป็นอาหารจากก้นบ่อ และกินเศษอาหารจากสัตว์อื่น ซากสัตว์ และสัตว์ขนาดเล็ก กั้งทั้งพื้นเมืองและรุกรานอาศัยอยู่ในแม่น้ำมิสซิสซิปปี้
ปลาดุก
ปลาดุกช่องเป็นภาพทั่วไปในแม่น้ำมิสซิสซิปปี้ เป็นปลาดุกหลายชนิดมากที่สุด ปลาเหล่านี้สามารถเติบโตได้ในขนาดที่น่าแปลกใจ และส่วนใหญ่ติดอยู่ที่ก้นแม่น้ำ พวกมันโดดเด่นในเรื่องแนวโน้มที่จะโจมตีเหยื่อหลายชนิด แต่พวกมันควรกินน้อยครั้งเนื่องจากอันตรายจากการปนเปื้อนของ PCB (โพลีคลอริเนต
กบเสือดาว
กบลายจุดเหล่านี้เรียกอีกอย่างว่ากบทุ่งหญ้า พวกเขาอาศัยอยู่ในและรอบ ๆ แม่น้ำมิสซิสซิปปี้ พวกเขามักจะทำหน้าที่เป็นตัวบ่งชี้ด้านสิ่งแวดล้อมเนื่องจากมีความอ่อนไหวต่อสารมลพิษและสารปนเปื้อน พวกเขาใช้เวลาส่วนใหญ่ไปตามริมลำธารและแหล่งน้ำอื่นๆ และกินแมลง สัตว์ขาปล้อง และสัตว์ไม่มีกระดูกสันหลังเป็นส่วนใหญ่