เช่นเดียวกับไบโอมส่วนใหญ่บนโลก ระบบนิเวศในทุ่งหญ้าสะวันนาสามารถดำรงอยู่ได้บนความสมดุลที่ละเอียดอ่อนระหว่างปัจจัยทางสิ่งแวดล้อมและสปีชีส์ต่างๆ รวมทั้งมนุษย์ ความแห้งแล้งอย่างรุนแรงสามารถปล้นทุ่งหญ้าเหล่านี้จากน้ำและใบไม้ที่ให้ชีวิต ในขณะที่นักล่าและ ชนเผ่าพื้นเมืองมักจะขู่ว่าจะทำลายใยอาหารผ่านการฆ่าสัตว์เพื่อการกีฬาหรือ การอยู่รอด
กิจกรรมของมนุษย์
กิจกรรมของมนุษย์อาจคุกคามอย่างรุนแรงที่จะทำลายระบบนิเวศของทุ่งหญ้าสะวันนา การใช้น้ำและวิธีการชลประทานที่ไม่ยั่งยืนอาจทำให้แม่น้ำและหลุมน้ำที่ให้ชีวิตแห้ง ในภูมิภาคที่คนพื้นเมืองมักใส่เนื้อป่า ซึ่งเป็นอาหารของพวกเขา ประชากรกีบเท้าลดลงในอัตราที่เห็นได้ชัดเจน สัตว์ป่าในทุ่งหญ้าสะวันนาบางชนิดยังถูกล่าเป็นถ้วยรางวัลอีกด้วย โดยเฉพาะอย่างยิ่งแรดดำถูกล่าเพื่อเขาอันมีค่า แม้แต่พืชบางชนิดก็ถูกเก็บเกี่ยวมากเกินไปเนื่องจากมูลค่าทางการค้า งานแกะสลักที่ทำจากไม้แอฟริกันแบล็ควูดซึ่งเป็นต้นสะวันนามักขายในตลาดนักท่องเที่ยว
ภัยแล้งและการแทะเล็มหนัก
ความแห้งแล้งที่รุนแรงเป็นเวลานานส่งผลเสียต่อระบบนิเวศในทุ่งหญ้าสะวันนา โดยมีรูปแบบการแทะเล็มทวีความรุนแรงยิ่งขึ้น การรวมกันของความแห้งแล้งที่รุนแรงและการแทะเล็มหญ้าสามารถเปลี่ยนทุ่งหญ้าของหญ้ายืนต้นที่กินได้เป็นหลักให้กลายเป็นทุ่งหญ้าสะวันนาที่มีหญ้าและพืชกินไม่ได้ ทุ่งหญ้าที่เล็มหญ้าเล็กน้อยรักษาคุณภาพของหญ้าพันธุ์ไม้ยืนต้นที่น่ารับประทาน แต่องค์ประกอบของพืชยังสามารถเปลี่ยนแปลงได้ ผู้เชี่ยวชาญได้เรียกร้องให้มีการแก้ปัญหาการจัดการทุ่งเลี้ยงสัตว์ในช่วงฤดูแล้งเพื่อส่งผลต่อทิศทางของการเปลี่ยนแปลงที่อาจเกิดขึ้นต่อความยั่งยืนของทุ่งหญ้า
การทำให้เป็นทะเลทราย
ทุ่งหญ้าสะวันนาเขตร้อนมักติดกับพื้นที่แห้งแล้ง ทะเลทราย และการแพร่กระจายของสภาพเหมือนทะเลทรายไปยังพื้นที่ทุ่งหญ้าที่แห้งแล้งเรียกว่าการแปรสภาพเป็นทะเลทราย ภัยคุกคามต่อระบบนิเวศในทุ่งหญ้าสะวันนานี้รวมถึงผลกระทบที่เกิดจากการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ การทำฟาร์ม การกินหญ้ามากเกินไป การชลประทานเชิงเกษตรเชิงรุก ซึ่งลดระดับน้ำขังห่างจากรากพืช การตัดไม้ทำลายป่า และ การกัดเซาะ ในแต่ละปีทุ่งหญ้าสะวันนาในแอฟริกามากกว่า 46,000 ตารางกิโลเมตรกลายเป็นทะเลทราย การปลูกพืชทนแล้งสามารถทำให้เนินทรายเคลื่อนตัวได้มั่นคง และเริ่มมีการขยายพันธุ์พืชเพิ่มเติม
การปล่อยคาร์บอน
การสำรวจในปี 2555 ระบุว่ามวลไม้ยืนต้นเพิ่มขึ้นอย่างมากจาก “ผลการปฏิสนธิ CO2” ผู้เขียน โดยระบุว่าการเพิ่มขึ้นของอัตราการเจริญเติบโตของไม้ยืนต้นเกิดจากการเพิ่มคาร์บอนในชั้นบรรยากาศ ไดออกไซด์ จำนวนต้นไม้และพุ่มไม้ที่เพิ่มขึ้นอย่างมากอาจคุกคามระบบนิเวศของทุ่งหญ้าสะวันนาทั้งหมด เนื่องจากพืชเหล่านี้ใช้น้ำมากกว่าหญ้า นักอนุรักษ์ในนามิเบียรายงานว่าไม้ยืนต้นได้ขัดขวางทั้งละมั่งและ เสือชีตาห์ที่ตามล่าพวกมัน – การพัฒนาที่อาจส่งผลกระทบที่ไม่ทราบได้ทั่ว ทุ่งหญ้า