ฟอสซิลมาในสองประเภท: ติดตามฟอสซิล และฟอสซิลของร่างกาย ซากดึกดำบรรพ์ ได้แก่ รอยเท้า รอยฟัน และรัง ส่วนซากดึกดำบรรพ์ของร่างกาย ได้แก่ กระดูก ฟัน กรงเล็บ และผิวหนัง ฟอสซิลของร่างกายที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้อย่างดีที่สุดนั้นมาจากส่วนที่แข็งที่สุดของร่างกาย
กระดูกเป็นฟอสซิลของร่างกายที่พบได้บ่อยที่สุด และเป็นแหล่งสำคัญของสิ่งที่เรารู้เกี่ยวกับไดโนเสาร์ กระดูกไดโนเสาร์ชิ้นแรกถูกค้นพบในปี พ.ศ. 2361 แต่ในปี พ.ศ. 2401 วิลเลียม พาร์คเกอร์ โฟล์คพบโครงกระดูกที่เกือบจะไม่บุบสลายของฮาโดรซอรัสในเมืองแฮดดอนฟิลด์ การค้นพบนี้เปลี่ยนมุมมองทางวิทยาศาสตร์ของโลกธรรมชาติ
ซากดึกดำบรรพ์บางส่วนเรียกว่า "ซากที่ไม่เปลี่ยนแปลง" ซึ่งหมายความว่ามีการเปลี่ยนแปลงทางกายภาพหรือทางเคมีน้อยมาก โครงกระดูกบางชนิดชอบฝังอยู่ในธารน้ำแข็ง ในขณะที่สัตว์ขนาดเล็กอื่นๆ ถูกพบว่าติดอยู่ในอำพันที่คงสภาพไว้ การแช่น้ำมันดินยังช่วยรักษาซากดึกดำบรรพ์ของร่างกายและเป็นเครื่องมือในการอนุรักษ์เนื้อเยื่ออ่อนและกระดูก
ในบางกรณี นักบรรพชีวินวิทยาค้นพบรอยประทับของโครงกระดูกในหินและวัสดุอื่นๆ แม่พิมพ์เหล่านี้ยังถูกกำหนดให้เป็นฟอสซิลของร่างกาย การหล่อจะเกิดขึ้นเมื่อราเต็มไปด้วยสารอื่นเพื่อให้เห็นภาพฟอสซิลที่เป็นบวก