เครื่องหมุนเหวี่ยงเป็นเครื่องมือที่ประกอบด้วยช่องที่หมุนบนแกนกลาง การเคลื่อนที่แบบหมุนทำให้วัสดุแยกจากกันตามแรงโน้มถ่วงที่ต่างกัน โรเตอร์หมุนเหวี่ยงคือหน่วยหมุนของเครื่องหมุนเหวี่ยงซึ่งมีรูเจาะตายตัวอยู่ที่มุมหนึ่ง หลอดทดลองวางอยู่ภายในรูเหล่านี้และโรเตอร์จะหมุนเพื่อช่วยในการแยกวัสดุ โรเตอร์หมุนเหวี่ยงมีสามประเภท: โรเตอร์ถังสวิง โรเตอร์มุมคงที่ และโรเตอร์แนวตั้ง
โรเตอร์ถังสวิงมักจะรองรับตัวอย่างที่มีปริมาตรตั้งแต่ 36 มล. ถึง 2.2 มล. Swing-buckets รองรับการแยกสองประเภท: rate-zonal และ isopycnic ควรใช้ถังสวิงสำหรับการแยกโซนตามอัตรา เนื่องจากระยะห่างระหว่างด้านนอกของวงเดือนกับด้านนอกของด้านล่างของท่อยาวพอที่จะทำให้เกิดการแยกออก
โรเตอร์แบบมุมคงที่มักจะใช้สำหรับการอัดเม็ดกับอนุภาคเม็ดจากระบบกันสะเทือนและขจัดเศษส่วนเกินหรือเพื่อรวบรวมเม็ด โพรงของโรเตอร์มีตั้งแต่ 0.2 มล. ถึง 1 มล. สิ่งสำคัญที่สุดในการตัดสินใจใช้โรเตอร์ที่มีมุมคงที่คือปัจจัย K ปัจจัย K บ่งชี้ว่าโรเตอร์สามารถอัดเม็ดที่ความเร็วสูงสุดได้อย่างมีประสิทธิภาพเพียงใด ยิ่งปัจจัย K ต่ำเท่าใด ประสิทธิภาพการอัดเม็ดก็จะยิ่งสูงขึ้น
โรเตอร์แนวตั้งมีความเชี่ยวชาญสูง โดยทั่วไปจะใช้เพื่อรัด DNA ในซีเซียมคลอไรด์ โรเตอร์แนวตั้งมีปัจจัย K ที่ต่ำมาก ซึ่งมีประโยชน์หากอนุภาคต้องเคลื่อนที่เป็นระยะทางสั้น ๆ เท่านั้นจนกระทั่งกลายเป็นเม็ด รันไทม์ของโรเตอร์แนวตั้งสั้น