Ett ekosystem definieras som ett samhälle av djur, växter och mikroorganismer som överlever och interagerar med varandra i samma miljö. Ekosystem kan vara små och stora. Ett exempel är ett skogsekosystem som är bebodd av levande saker som samexisterar med fysiska faktorer i miljön, såsom temperatur, solljus och syre. Skogsekosystemet beror på tillgången på stora resurser för att trivas.
Skogsskyddet är ett viktigt inslag i ett skogsekosystem. Det avser den översta delen av en grupp av träd eller växtekronor. En skogstak består av gränssnittet mellan atmosfären och landet. Baldakinen är också den övre livsmiljön för andra biologiska organismer i ett skogens ekosystem. Den består mestadels av stora träd. Skogsbalkens struktur är inte densamma i alla skogsekosystem eftersom det beror på tillgången på näringsämnen, trädarrangemang och skillnader i biologiska arter. Mer än hälften av växtarterna finns i ett skogsekosystem, så den biologiska mångfalden är störst i skogen. De flesta organismer har möjlighet att överleva i skogstaket eftersom de utsätts direkt för solljus och regnvatten.
Skogsbotten är det mest utmärkande för ett skogens ekosystem. Den består av fallna löv, stjälkar, kvistar, grenar och bark på markytan. En skogsbotten innehåller också organiska och oorganiska ämnen. Många levande organismer, som svampar, bakterier och andra mikroorganismer, bor i skogsbotten. Den är rik på näringsämnen och mineralinnehåll. Skogsbotten har en viktig roll i överföringen av näringsämnen i skogens ekosystem. Det mesta av kolet och energin från skogens ekosystem läggs till skogsbotten över tiden. De flesta näringsämnen i skogens ekosystem kommer från skogsbotten på grund av nedbrytning av organiska ämnen.
Marken är ett inslag i ett skogens ekosystem som påverkas av förändringar i klimat, geologi, mängd nederbörd och vegetation. Jorden i tempererade skogar är mer bördig eftersom trädens löv faller till marken varje höst. Denna kull bidrar till de lager av organiskt material som finns i skogsmark. De gamla bladen blir en matkälla för bakterier och svampar. Dessa organismer underlättar nedbrytningen av bladen och annat organiskt material. Sönderfall berikar skogsmarken eftersom det ger mer näringsämnen till de levande träden och växterna i skogens ekosystem. Marken i tropiska regnskogar har dock dålig kvalitet på grund av kraftiga regn. Det konstanta regnet urholkar och löser upp näringsämnen i jorden innan träden kan dra nytta av dem.