Det marina ekosystemet är under allvarlig stress; på många områden är förutsättningarna för att upprätthålla livet antingen i fara eller obefintliga. Förstörelsen av marina livsmiljöer är särskilt utbredd längs kustlinjer där människans befolkning har ökat. Habitatförlust, föroreningar, överfiske, destruktiva fiskemetoder och Global uppvärmning alla undergräver den marina miljön.
Kustlinjer
Habitatförlust, föroreningar, avrinning och ökad salthalt förstör korallrev, havsgräs och andra livsmiljöer för fåglar och fiskar. När kustnära våtmarker fylls i för att rymma växande mänskliga populationer minskar uppdämningen av floder flödet av sötvatten, saktar avloppet av näringsämnen och hämmar fiskens migration. Mindre sötvatten innebär ökad salthalt i våtmarker och flodmynningar, vilket skadar gräset som renar vatten när det rinner till havet. Erosion orsakad av avskogning skickar silt i floder, vattendrag och så småningom havet och blockerar solljuset som behövs för att korallreven ska överleva.
Överfiske
Maximal hållbar avkastning beräknas av fiskeribiologer för att uppskatta mängden fisk som kan skördas från en befolkning utan att riskera dess långsiktiga livskraft. Mellan 1974 och 1999 tredubblades andelen fiske som överträffade den maximala hållbara avkastningen för torsk, från 10 procent till 30 procent. Enligt Center for Ocean Solutions har den totala fångsten sedan början av 1990-talet varit en av världens mest produktivt fiske, Okhotskhavet, har minskat mellan två och två och en halv gång på grund av överfiske. I Stilla havet hanterar mer än hälften av önationerna inte sina korallrev på ett hållbart sätt.
Havsbotten
Kommersiella fiskefartyg använder en praxis som kallas bottentrålning och drar stora nät som är fästa vid tunga vikter över havsbotten. Riktade arter inkluderar räkor, torsk, tunga och skrubb, men allt längs havsbotten fångas. Bottentrålning kan lämna det marina ekosystemet permanent skadat och bifångsten (icke-målarter som havssköldpaddor, sjöfåglar och däggdjur) kastas helt enkelt överbord. Bifångster kan uppgå till 90% av den totala fångsten och hotad fisk och djuphavskoraller dödas ofta.
Försurning
När klimatet värms upp absorberar havet mer koldioxid, vilket gör det surare. Ökad surhetsgrad hämmar förmågan hos marina organismer att utveckla skal, och detta inkluderar de små djur som kallas plankton som utgör basen till havets matväv. Vissa forskare föreslår att detta också kommer att få vissa marina arter att släppa ut färre av svavelföreningarna som främjar molnbildning, vilket kyler jorden. Klimatmodeller förutsäger att detta kommer att orsaka 0,5 grader Celsius (0,28 grader Fahrenheit) ytterligare uppvärmning under detta århundrade.