Mycket få bakterier producerar endosporer. Endast några av dessa arter i Firmicute phylum producerar endosporer, som är icke-reproduktiva strukturer som innehåller DNA och en del av cytoplasman. Endosporer är inte sanna sporer eftersom de inte är avkomma till bakterien. Endosporer bildas när bakterier utsätts för extrema eller ogynnsamma miljöförhållanden. De kan överleva under långa perioder även när de svälter av mat och när de utsätts för kemikalier och temperaturer som normalt skulle döda bakterierna.
Bacillus bakterier
Bakterier i släktet Bacillus är de vanligaste studerade av alla endosporeproducerande bakterier. Bacillus-bakterier är olika och trivs i många olika miljöer. Endosporerna hos dessa bakterier är mycket giftiga för många organismer, inklusive människor. Patogenen Bacillus anthracis är ett välkänt toxin som har använts av både forskare och terrorister. Det finns dock många andra arter av Bacillus.
Clostridium-bakterier
Liksom andra arter av endosporeproducerande bakterier är Clostridium-bakterier gram-positiva, vilket indikerar att de har liknande egenskaper såsom cellväggsstruktur. Grampositiva bakterier är känsliga för samma eller närbesläktade antibiotika. Bakterier i släktet Clostridium är ansvariga för ett brett spektrum av mänskliga sjukdomar som sträcker sig från mild matförgiftning till botulism samt stelkramp och gas gangrene.
Desulfotomaculum-bakterier
På samma sätt som andra endosporeproducerande bakterier är bakterier i släktet Desulfotomaculum också ansvariga för matförlust och sjukdom. Desulfotomaculum-bakterier kan få dåliga konserver att förstöra. Där de finns i överflöd producerar de en obehaglig svavelliknande lukt.