Протисти и бактерије припадају различитим доменима живота, еукариотима и прокарионима, опуштеним дугим еонима еволуције. Без обзира на то, као и сви облици живота на Земљи, они деле заједничког претка, па самим тим постоји низ интригантних сличности. Упркос невероватној разноликости и протиста и бактерија, можете направити неколико уопштавања о томе шта им је заједничко.
Генетски код
Код протиста, бактерија и свих осталих организама, одређене секвенце хемијских парова база у ДНК кодирају одређене аминокиселине. Код је готово универзалан, у смислу да ће иста секвенца из ДНК кодирати исту секвенцу аминокиселина и у протесту и у бактерији. Изузеци од ове универзалности укључују чињеницу да неке бактерије користе секвенцу УАГ за кодирање пиролизина уместо стоп кодона, што је начин на који се користи у другим организмима. Без обзира на то, код је углавном изузетна сличност између бактерија и протеста.
Рибозоми
И бактерије и протисти прво преписују делове свог ДНК кода у РНК, а затим преводе ову РНК у протеин користећи сложене структуре зване рибосоми. Опет, протести и бактерије деле ове сличности са свим осталим познатим облицима живота. Структура рибозома се донекле разликује између бактерија и еукариота попут протиста. Ова разлика је такође важна, јер неки антибиотици убијају бактерије користећи разлике између бактеријских и еукариотских рибосома.
Ћелијске мембране
И бактерије и протисти имају ћелијске мембране направљене од хемикалија које се називају фосфолипиди. Фосфолипид у бактерији или у протесту има на једном крају растворљиву групу и у води нерастворљив реп са друге стране, па су ћелијске мембране бактерија и протиста изграђене од двослоја од фосфолипиди. Репови на обе усмерени су ка центру двослоја. Бактерије, поред ћелијске мембране, имају и ћелијски зид, а неке бактерије имају и унутрашњу и спољну мембрану.
Високо конзервирани процеси
Бактерије и протисти деле запањујуће сличности у разним биохемијским процесима који су такође врло слични онима у свим другим животним облицима. Процес који бактерије и протисти користе за разградњу глукозе назива се гликолиза. Иако постоје неке варијације, гликолиза се одвија у скоро свим познатим организмима. Слично томе, процес репликације ДНК је врло сличан између бактерија и протиста са неким мањим разликама.