Развијена почетком 20. века, гасна хроматографија (ГЦ) је метода која се користи за одвајање и анализу компонената смеша - посебно смеша испарљивих течности попут бензена. Ово раздвајање се постиже прво испаравањем смеше; масени спектрометар прикључен на хроматографску јединицу се затим користи за правилно идентификовање једињења у смеши.
Након убризгавања узорка у машину за хроматографију, мешавина се испари и инертним гасом се компоненте проводе кроз цев. У цеви испариване компоненте пролазе кроз течност или стационарну фазу унутар цеви. Стационарна фаза се користи да спречи пролазак гасова у потпуности кроз колону. Што је компонента испарљивија, то је мање у интеракцији са стационарном фазом. Стога, што гас брже пролази кроз цев - то је испарљивији.)
На другом крају цеви налази се детектор дизајниран да осети сваку компоненту смеше. Како једињење напушта цев, детектор може да одмери количину помоћу једне од неколико метода. Неки детектори користе пламен за сагоревање узорка, стварајући јоне. Ови јони се детектују мерењем електричне проводљивости пламена. Друга врста детектора мери присуство испариваног узорка променом проводљивости носећег гаса.
Излази података из детектора појављују се као линијски графикон, а количина откривеног једињења приказана је временом. Најхлапљивије једињење се прво појављује као врх на графикону. Наредни врхунци на графикону представљају поступно мање испарљиве компоненте оригиналне смеше. Научници могу да користе ове хроматограме за даље разбијање хемијских својстава узорка смеши, с тим што би удео величина врхова био у односу на количине супстанци у узорак. Научници користе подручја испод врхова да одреде њихове величине.
Масени спектрометар је посебно користан када се анализира састав непознате смеше. Јединица за комбиновану гасну хроматографију-масену спектрометрију (гц-мс) скенира масе компонената приликом њиховог померања из цеви. Масени спектрометар испаљује енергетске електроне на покретни испарени узорак, јонизујући његове молекуле. Затим анализатор сортира јоне користећи њихов однос масе и наелектрисања. Комбиноване гц-мс јединице су идеалне јер могу тренутно да одреде масу компонената и могу да идентификују компоненте које се не раздвајају у потпуности.