Екосистеми прашуме пружају дом неким од најгушћих и најразноврснијих животињских заједница на Земљи. Међутим, прашуме се непрестано експлоатишу због својих богатих ресурса. Људске праксе попут рударства и крчења шума имају озбиљне ефекте на ова станишта, узрокујући небројене врсте животиња алармантном брзином да изгубе своје домове.
Птице
Неколико врста тукана, папагаја и других тропских птица кишних шума Јужне и Централне Америке прети изумирањем због сече шума и других узрока крчења шума. Орао харпи, једна од највећих познатих врста орлова на свету, успева у тропским нижим прашумама од јужног Мексика до источне Боливије; станиште ове птице се непрестано смањује због чисте праксе крчења шума, као и уништавања места за гнежђење од индустријских пракси као што су рударство и бушење нафте. Губитак станишта такође прети хиљадама врста птица селица. Ове врсте путују на север током северноамеричког лета, а током зиме се враћају у тропске крајеве; све се више враћа сваке године да не пронађе дом и / или уништена места за гнежђење.
Сисари
Широки спектар врста сисара губи своје домове у прашуми, од најмањег глодара до највећег предатора. Многим већим сисарима треба довољно простора за исхрану и / или лов. Како индустријска пракса напредује у одређеним областима, сисари прашуме, попут горила, јагуара и пуми, морају се ограничити на уситњена станишта са недовољним ресурсима. Крчење шума најдиректније погађа дрвене сисаре (оне који живе на дрвећу), попут летеће веверице и воћног слепог миша, као и неколико врста мајмуна. Читаве заједнице остају без домова, што их тера да се прилагоде окружењу без дрвећа за које нису спремне.
Гмизавци и водоземци
Крчење шума представља главни узрок губитка станишта већине гмизаваца прашуме, док многе врсте водоземаца такође губе домове због праксе бушења и рударства нафте које загађују баре, реке и потоке, приморавајући их да пронађу нове изворе воде за своје полуводене стилове живота. Угрожене и угрожене врсте гмизаваца и водоземаца укључују златну крастачу, мадагаскарског гекона и игуане, као и неколико врста отровних жаба, најпознатијих у Колумбији.