Bakterije so majhni enocelični organizmi, ki so koristni in škodljivi za človeka. Nekatere oblike bakterij nam pomagajo živeti, na primer tiste, ki pomagajo razgraditi hrano v črevesju. Druge oblike, na primer bakterije, ki povzročajo bubonsko kugo, lahko človeka ubijejo, če se ne zdravi. Obstaja veliko različnih vrst bakterij, ki se počutijo z različnimi metodami. Dve glavni metodi bakterijskega dihanja sta aerobno dihanje in anaerobno dihanje.
Aerobno dihajoče oblike bakterij potrebujejo kisik za življenje. Kisik uporabljajo kot gorivo, da pomagajo pri izgorevanju energije in jim zagotavljajo energijo, potrebno za življenje. Ta vrsta bakterijskega dihanja je ista vrsta, kot jo uporabljajo ljudje, zato izraz "aerobna vadba". Glavni stranski produkt aerobnega dihanja bakterij je ogljikov dioksid.
Številne vrste bakterij se anaerobno počutijo. Z drugimi besedami, lahko gredo skozi postopek dihanja brez prisotnega kisika. Namesto da bi jim kisik pomagal pri izgorevanju energije v hrani, te vrste bakterij z drugimi naravnimi kemikalijami ustvarjajo kemične reakcije in sproščajo energijo, ki jo potrebujejo. Med običajne kemikalije, ki se pojavljajo v naravi, so nitrati, sulfati in ogljikov dioksid. Anaerobno dihanje pri bakterijah na splošno ustvarja veliko stranskih produktov. Mnogi od teh stranskih produktov so lahko strupeni ali nevarni za ljudi in vključujejo etanol in vodik.
