Mikrobiologija je preučevanje organizmov, ki so premajhni, da bi jih bilo mogoče videti z nevidnim vidom. Mikrobiologijo lahko razvrstimo na več različnih načinov, kot se za študij organizmov, ki so veliko večcelični, presegajo. Mikrobiologije lahko obravnavamo kot preučevanje različnih taksonomskih delitev ali razdelimo na skupine preučevanih organizmov. Mikrobiologijo lahko obravnavamo tudi kot zbirko različnih področij študija ali pa jo razdelimo na podlagi različnih dejavnosti, ki jih izvajajo mikrobiologi.
Oddelki
Biologi so vse življenje na Zemlji razvrstili v eno od treh ogromnih taksonomskih skupin, imenovanih domene: arheje, bakterije in evkarije. Arheje in bakterije so prokarionti, organizmi, katerih celice nimajo osrednjega jedra. Vsi so enocelični organizmi. Bakterije na splošno odlikuje značilna struktura njihove zunanje obloge - celična stena, zgrajena iz molekul, imenovanih peptidoglikani. Arheje so podobne bakterijam, le da njihova notranja biokemija deluje po drugačnih pravilih in so mnoge od njih prilagojene težkim okoljem. Za evkarije so značilne celice, ki imajo v svojih celicah jedra in druge edinstvene notranje strukture. Čeprav so številni evkarionti veliki organizmi, kot so sloni, sekvoje in ljudje, je velika večina evkariontskih vrst enoceličnih mikroorganizmov.
Skupine
Drug način ločevanja študija mikrobiologije so vse skupine enoceličnih organizmov. To ignorira taksonomsko raven organizmov in v bistvu šteje, da vse entitete pod določeno velikostjo spadajo pod okrilje mikrobiologije. Sem spadajo bakterije in arheje, ki so domene, in glive, alge in praživali, ki so kraljestva v domeni evkarije. Vključuje tudi viruse, ki niso v nobeni taksonomski klasifikaciji živih organizmov.
Med glive spadajo plesni in kvas. Alge so enocelične rastline, takšne, ki površino ribnika obarvajo zeleno ali rumeno. Protozoji so kot enocelične živali - na splošno so bolj gibljivi kot alge ali glive. Virusi so povsem druga skupina entitet, ki prečkajo mejo med živimi in ne živimi, vendar njihova študija spada tudi pod okrilje mikrobiologije.
Discipline
Mikrobiologijo lahko razvrstimo tudi po disciplinah, ki preučujejo mikrobiologijo. Na primer, imunologi preučujejo mehanizme človeških bolezni, ki jih povzroča okužba s bakterije, glive, virusi ali praživali, medtem ko epidemiologi preučujejo način okužbe prenesena. Prehranski in kmetijski mikrobiologi preučujejo način uporabe gliv ali bakterij za proizvodnjo hrane - skupaj z mehanizmi, s katerimi lahko mikroorganizmi poškodujejo pridelke. Biotehnologi iščejo načine za uporabo mikroorganizmov za proizvodnjo materialov, uporabnih za človeštvo.
Dejavnosti
Mikrobiologi med preučevanjem mikroskopskih entitet opravljajo različne dejavnosti, mikrobiologijo pa lahko razvrstimo tudi na podlagi teh dejavnosti. Te so priročno organizirane v skupine, imenovane šest "Jazov". Teh šest "I" se lahko izrazi kot cepljenje, inkubacija, izolacija, pregled, preiskava in identifikacija. Nanašajo se na procese gojenja, vzorčenja, opazovanja in testiranja mikroorganizmov.
