Voda, ki se uporablja v domovih, podjetjih in industriji, se pogosto čisti s kemičnim postopkom za odstranjevanje škodljivih snovi in bakterij. Ko je voda kemično obdelana, jo je mogoče varno reciklirati nazaj v vodni vir. Za obdelavo vode lahko uporabimo več različnih kemikalij, kot so klor, apno in vodikov peroksid. Vsaka metoda ponuja različne prednosti in slabosti za uporabo pri čiščenju vode.
Klor
Po mnenju Sveta za kakovost in zdravje voda je bila pred uporabo klorirane pitne vode na prelomu reke stoletja, bolezni, ki se prenašajo z vodo, kot so kolera, tifusna mrzlica, dizenterija in hepatitis, terjale po tisoče ameriških življenj leto. Danes je kloriranje še vedno najpogostejša metoda razkuževanja javne pitne vode in bazenov. Ne samo, da kloriranje pomaga preprečevati širjenje okužb, kot je E. coli, uničuje tudi bakterije, alge in plesen, ki lahko rastejo na stenah sistemov za shranjevanje vode, iz pitne vode pa odstranjuje neprijetne okuse in vonjave. Čeprav je kloriranje učinkovito pri saniranju pitne vode, ga je težko obvladati brez strokovnega znanja in izkušenj. Kloriranje vode, ki se uporablja za prhanje, pranje in plavanje, lahko izsuši kožo in lase, lahko povzroči draženje oči in lahko tudi zbledi tkanine.
Lime
Trda voda vsebuje visoko vsebnost raztopljenih mineralov, ki se lahko kopičijo v vodovodnih ceveh in notranjih sistemih ter povzročijo ovire in trajne poškodbe. Mehčalci vode, izdelani iz hidratiranega apna, lahko izboljšajo kakovost vode za izboljšanje trde vode in tudi zmanjšajo raven strupenega arzena v pitni vodi. Apno spreminja tudi pH vode in uničuje okolje, potrebno za rast bakterij in virusov. V nekaterih primerih ravni pH postanejo previsoke z mehčanjem apna. Ko apnu dodamo klorirano vodo, je nastala hipoklorit razkužilo, ki je slabše od ostalih ostankov prostega klora.
Vodikov peroksid
Vodikov peroksid je belilno sredstvo, ki se lahko uporablja za beljenje zob, posvetlitev las ter beljenje tkanin in tekstila. Uporablja se lahko tudi za razkuževanje vode z odstranjevanjem onesnaževal in zaviranjem rasti bakterijskih snovi. Vodikov peroksid se na splošno šteje za varen, ne ustvarja ostankov ali plinov in ga lahko uporabimo za odstranjevanje ostankov klora, ki ostanejo pri kloriranju. Snov je treba prevažati in z njo ravnati previdno, saj lahko stik z vodikovim peroksidom povzroči draženje oči, kože, pljuč in sluznice. Poleg tega Lenntech ugotavlja, da študije, ki jih je izvedla Ameriška mednarodna agencija za raziskave raka, kažejo, da je izpostavljenost vodikovemu peroksidu na visoki ravni lahko rakotvorna za živali.