Večji del Aljaske je obdan z vodo. Na severu oziroma severozahodu sta dve vodni telesi Aljaske, morje Beaufort in morje Chukchi, ki se združita v Arktični ocean. Na jugovzhodu je Aljaški zaliv, ki se zlije v Tihi ocean. Beringovo morje je na jugozahodu.
Arktični ocean
Arktični ocean je najmanjši od vseh oceanov. Leži skoraj v celoti nad polarnim krogom in je večino časa zelo mrzlo in pokrito z ledom. Greben Lomonosov ga deli na dva bazena, Evroazijski bazen in Severnoameriški bazen. Izhodi za ta ocean so Beringova ožina med Aljasko in Rusijo; ožino Davis med Grenlandijo in Kanado; Danska ožina in Norveško morje med Grenlandijo in Evropo. V tem oceanu so zaradi nizke temperature domovi rib, tjulnjev, mrožev in kitov. Sredino tega oceana pokriva povprečno 10 čevljev debel polarni ledenik, ki se v zimskih mesecih razprostira navzven, podvoji velikost in se razširi na obkrožajoče kopne mase. Odprto morje v poletnih mesecih obkroža ledenik, vendar nikoli popolnoma ne izgine.
Tihi ocean
Tihi ocean je največji od vseh oceanov. Pokriva približno 28 odstotkov svetovne površine in je 15-krat večja od ZDA. Pozimi se morski led in številne ladje od oktobra do maja tudi zaledenijo. Tihi ocean je dom oblik morskega življenja, kot so morski levi, morske vidre, tjulnji, želve in kiti. V Tihem oceanu je ekonomsko dostopen, razmeroma poceni pomorski prevoz, obsežna ribolovna območja, nafta in plin na morju polja, minerali ter pesek in gramoz za gradbeno industrijo in več kot 60 odstotkov svetovnih rib prihaja s Tihega oceana Ocean.
Aljaški zaliv
Aljaški tok in Aljaški obalni tok prevzameta Aljaški zaliv. Ti tokovi delujejo kot poti za organizme in vire, od katerih so odvisni. Nekaj dotokov, kot sta Cook Inlet in Prince William Sound, ščiti organizme pred močnimi tokovi. Ta zaliv vsebuje številne velike ledenike in ledene gore, ki jih močni tokovi prenašajo v morje.
Beringovo morje
Beringovo morje je eden največjih morskih ekosistemov na svetu. Je med Sibirijo in Aljasko. Na severu je z Beringovo ožino povezan z Čukoškim morjem in Arktičnim oceanom; Tihi ocean leži na jugu Beringovega morja, mimo Aleutskih otokov in polotoka Aljaska, od koder otoki vodijo.
V Beringovem morju živijo številne velike ptice in morske živali, kot so tjulnji in kiti. Temperatura morja se je v zadnjih 50 letih povečala, kar je zmanjšalo nekatere populacije rib in morskih živali. To skrbi ljudi v ribiški industriji, saj je bilo to morje eden glavnih virov rib.
Beaufortovo morje
Beaufortovo morje je severno od Aljaske znotraj Arktičnega oceana. Ime je dobil po britanskem kontraadmiralu siru Francisu Beaufortu. Morje pokriva približno 184.000 kvadratnih kilometrov in povprečna globina je 3.239 čevljev, vendar se spusti do 15.360 čevljev navzdol. Morje je v osrednjem in severnem območju zamrznjeno, obalni ledenik pa se odpre avgusta in septembra. Kiti in morske ptice so dve najpogostejši živali v bližini Aljaske v Beaufortovem morju. Leta 1986 so v aljaškem zalivu Prudhoe, ki je znotraj tega morja, našli številne zaloge nafte.
Čukčijevo morje
Morje Chukchi je tudi znotraj Arktičnega oceana, severozahodno od Aljaske. To morje vsebuje plitvo dno, ki zagotavlja hranila in življenjski prostor za živali, kot so mroži, ledeni tjulnji, kiti, morske ptice in severni medvedi. V tem morju živi desetina svetovne populacije severnih medvedov. Spreminjajoče se podnebje, ki povzroča dvig temperature, vpliva na populacijo polarnih medvedov, ker jim tali led otežuje lov na hrano. Medtem ko se morski led še vedno topi, se številna naftna in plinska podjetja zanimajo za vrtanje na tem posebnem območju.