V reki Mississippi živijo številne vodne rastline in živali v zapletenem, medsebojno povezanem ekosistemu. Vodne rastline zagotavljajo hrano in zavetje številnim različnim vrstam v reki in so lahko tako majhne kot enocelične alge. V reki Mississippi je vrsta živali, od nevretenčarjev do rib, žab in drugih.
Alge
Po podatkih oddelka za naravne vire v Iowi Mississippi gosti dve glavni vrsti alg: zeleno in modro-zeleno. Zelene alge so osnovna biološka sestavina vsakega zdravega ekosistema; ustvarijo velike kolonije, ki lahko vodi dajo zeleno barvo. Modrozelene alge so manj zaželene in veljajo za nadležne alge. Povezani so s poudarjenimi ekosistemi in lahko ribam povzročijo neprijetne okuse ali ubijejo celotno populacijo.
Duckweed
Ta običajna prosto plavajoča rastlina ima en sam droben list in korenine, ki v vodi visijo, da sesajo hranila. Kot nakazuje že njeno ime, je rakica pomemben vir hrane za številne vodne ptice.
Vodni liliji
Beli vodni lili so običajno mesto v reki Mississippi in so sestavljeni iz velikih plavajočih listov z usnjato teksturo. Na vrhu listov dajo velike bele cvetove in so zakoreninjeni v blatu spodaj.
Raki
Ti raki, imenovani tudi raki ali raki, spominjajo na majhne jastoge. Predvsem se hranijo na dnu in porabijo ostanke drugih živali, mrhovine in malih živali. V reki Mississippi živijo tako domači kot invazivni raki.
Som
Kanalski somi so pogost prizor v reki Mississippi. So najštevilčnejša vrsta soma. Te ribe lahko zrastejo do presenetljivih velikosti in se držijo predvsem rečnega dna. Znani so po svoji nagnjenosti k udarjanju številnih različnih vrst vab, vendar jih je treba redko jesti zaradi nevarnosti kontaminacije PCB (poliklorirani bifenil).
Leopardjeva žaba
Te pegaste žabe imenujemo tudi travniške žabe. Živijo v reki Mississippi in okoli nje. Zaradi občutljivosti na onesnaževala in onesnaževala pogosto služijo kot okoljska indikatorska vrsta. Večino časa preživijo ob robu potokov in drugih vodnih teles ter jedo večinoma žuželke, členonožce in druge nevretenčarje.
