Honduras je druga največja država v Srednji Ameriki, ki se razteza po prevlaki od Karibov do Tihega oceana. Kljub agresivnemu krčenju gozdov Honduras še vedno ohranja več gozdnatih površin kot večina drugih držav v regiji. V pokrajini prevladuje več vrst gozdov, vključno z oblačnim gozdom, borovim gozdom, deževnim gozdom in mangrovami. V raznolikih gozdnih ekosistemih Hondurasa je veliko rastlinskih in živalskih vrst, vključno z vrstami, ki so izginile iz preostale regije. Za zaščito raznolikosti življenja na tem območju je bilo rezerviranih več kot eno zatočišče divjih živali v Hondurasu.
Sesalci v Hondurasu
V gozdovih Hondurasa najdemo več kot 200 vrst sesalcev. Med honduraške živali je vključenih več redkih bitij. Netopirji (Chiroptera) predstavljajo skoraj polovico sesalcev v državi, 98 znanih vrst pa zaseda vsak gozdni ekosistem. Znameniti jaguar (Panthera onca) je ena redkih vrst v celotni Srednji Ameriki. Jaguarji, najpogosteje opaženi na območjih mangrov, so v Hondurasu ogrožena vrsta. Zahodnoindijske morske krave (Trichechus manatus), ki so bile nekoč pogoste ob karibski obali Hondurasa, so danes redke, razen na oddaljenih območjih mangrov. Nacionalna žival Hondurasa, belorepi jelen (Odocoileus virginianus), je največja vrsta jelenov v državi. Belorepec, ki je najpogosteje viden v nižinah in borovih gozdovih, je zaščitena vrsta. V Hondurasu najdemo tudi najrazličnejše opice, vključno z beloglavim kapucinom (Cebus capucinus), Mehiška opica pajek (Ateles geoffroyi vellerosus) in opica z zlatim plaščem (Alouatta palliata palliata).
Obilje ptic
Honduras ima izjemno bogato raznolikost ptičjih vrst. Obstaja 18 vrst papig, med njimi oranžno-bradati paprika (Brotogeris jugularis), velika zelena ara ambigua), pacifiški pajek (Aratinga strenua) in škrlatni ara (Ara macao), ki je nacionalna ptica Hondurasa. Najdeno v visokogorskih tropskih gozdovih je pogoltna črnica (Notiochelidon pileata) ptica selivka, pogosta v Hondurasu. Kostanjev mandibuliran tukan (Ramphastos swainsonii) je pogost pogled v obalnih nižinskih gozdovih Hondurasa. Znani po svojem živobarvnem obrazu in pretirani naravi, jih včasih zadržujejo kot hišne ljubljenčke, čeprav so zaščitena vrsta.
Tropska drevesa
Vsak gozdni ekosistem ima ključno vrsto, kar pomeni, da ena vrsta opredeljuje vrsto gozda. V Hondurasu drevesa črne mangrove (Avicennia germinans) in rdeče mangrove (Rhizopora mangle) označujejo meje ekosistema mangrove. Drevesa mahagonija (Swietenia macrophylla) se včasih na suhem prepletajo z vrstami mangrov, kar kaže na začetek obalnih nižinskih borovih gozdov. Honduraški bor (Pinus caribaea var. hondurensis) in ocote bor (Pinus oocarpa) sta edini dve vrsti borov v državi, čeprav prevladujejo v ogromnih delih nižinskega gozda. Eno najbolj impresivnih dreves v Hondurasu je ceiba (Ceiba pentandra). Včasih imenovan kapok, je masivno drevo, ki lahko doseže 250 čevljev v višino z deblom premera 10 čevljev.
Cvetoče rastline
Rastlinstvo Hondurasa je zelo bogato. Znanstveniki ocenjujejo, da je v Hondurasu več kot 5000 vrst rastlin. Na večini območij države je veliko cvetočih rastlin, kjer zagotavljajo hrano vrstam žuželk in ptic. Ena najbolj plodnih rastlinskih vrst v Hondurasu je žajbelj (Salvia). Breskev žajbelj (Salvia dorisiana), Karwinski žajbelj (S. karwinskii) in modra vinska trta (Salvia cacaliifolia) so vse grmičaste, večletne vrste, ki uspevajo v hladnih, gorskih gozdovih osrednjega Hondurasa. Nekdaj vir hrane za avtohtone prebivalce je rumeni lotos (Nelumbo lutea) ena redkih cvetočih rastlin v gozdovih mangrov. Znano po svojih rumenih cvetovih v obliki skodelice, ga pogosto gojijo na vodnih vrtovih kot okrasno rastlino.