Ljudje se zanašamo na ekosisteme za oskrbo s hrano in drugimi potrebščinami za zdravo človeško življenje. Nekatere človekove dejavnosti pa so uničujoče vplivale na ekosisteme. Od onesnaženja do prekomerne nabiranja je škoda in izkoriščanje divjih živali in naravne vegetacije s strani človeka nekatere ekosisteme pustil v slabem stanju.
Onesnaženje ekosistemov
Številni stranski produkti industrializacije so škodovali ekosistemom. Na primer, sežig premoga za proizvodnjo energije sprošča kemikalije, kot je žveplov dioksid. Takšne kemikalije v zraku vodijo do kislega dežja in odlaganja kisline, kar lahko škoduje rastlinskemu in živalskemu svetu, zlasti ker zakisa vodne ekosisteme. Poleg tega lahko tekoči kemični odtok iz človekovih dejavnosti negativno vpliva na ekosisteme. Takšnega odtoka ne proizvajajo samo velike industrijske tovarne. Odtok cinka in svinca s trate, dovozov in pločnikov v stanovanjskih naseljih lahko škoduje ekosistemom.
Urbana širitev
Širjenje mest je vedno večje širjenje mest na nekdanja podeželska območja. Prišlo je do poseka in krčenja gozdov, da bi se zadovoljili pritiski urbanizacije v podeželska območja. Takšni dejavniki poleg izgube gozdov in druge vegetacije vodijo do razdrobljenosti habitatov. Ko ceste, domovi ali celo vozila prerežejo prvotno sestavo ekosistema, lahko živali odrežejo velik del svojega habitata in s tem tudi populacijo.
Predstavitev invazivnih vrst
Prenos vrst je lahko nehoten, na primer spore rastlin, ki se vozijo na čevlju. Ali uvedba nove vrste bi lahko bila namenoma, kot je bil primer z azijskimi krapi v ZDA. Po podatkih Nacionalne zveze za prosto živeče živali 42 odstotkov ogroženih živali ogrožajo tujerodne vrste. Te vrste predstavljajo težavo, ker tekmujejo za hrano in domačim vrstam morda ne bodo služile kot dobra hrana. Poleg tega lahko invazivne vrste zmanjšajo biotsko raznovrstnost in fizično spremenijo ekosistem. Invazivna vrsta lahko na primer spremeni kemično sestavo tal.
Prekomerno nabiranje ekosistemov
Prekomerno nabiranje, včasih imenovano prekomerno izkoriščanje, se zgodi, ko vrste odvzamemo iz naravnega habitata. To se lahko zgodi kot posledica uničenja habitata, pogosteje pa je posledica lova ali ribolova. Takšne nevzdržne dejavnosti je mogoče opaziti zlasti v ribiški industriji, kjer se je populacija vrst, kot so trska, vahnja in iverka, močno zmanjšala. Prekomerna nabiranje lahko privede do neravnovesja v ekosistemih, poruši prehranjevalno verigo in škoduje drugim neobranim vrstam.