Na Zemi slnečná energia poháňa vetry; takže na Neptúne, kde sa zdá, že slnko nie je o moc väčšie ako hviezda, by ste čakali slabý vietor. Opak je však pravdou. Neptún má najsilnejšie povrchové vetry v slnečnej sústave. Väčšina energie poháňajúcej tieto vetry pochádza zo samotnej planéty.
V porovnaní s ktoroukoľvek z plynných obrovských planét je zemská atmosféra zásobárňou pokoja. Na Jupiteri dosahuje vietor v Červenej škvrne 618 kilometrov za hodinu (384 míľ za hodinu), čo je takmer dvakrát rýchlejšie ako vietor v najprudšom pozemskom hurikáne. Na Saturn môže vietor v horných vrstvách atmosféry fúkať takmer trikrát silnejšie ako tento prúd, a to rýchlosťou 1 800 kilometrov za hodinu (1 118 míľ za hodinu). Aj tieto vetry ustupujú dozadu do blízkosti Neptúnovej Veľkej tmavej škvrny, ktorú astronómovia dosiahli rýchlosťou 1 931 kilometrov za hodinu (1 200 míľ za hodinu).
Rovnako ako Jupiter a Saturn, aj Neptún generuje viac energie, ako prijíma zo slnka, a táto energia vyžarujúca z jadra planéty poháňa silné povrchové vetry. Jupiter vyžaruje energiu, ktorá zostala po jej vzniku, a energia, ktorú vyžaruje Saturn, je z veľkej časti výsledkom trenia vyvolaného héliovým dažďom. Na Neptúne zachytáva teplo metánová vrstva, čo je skleníkový plyn. Keby bola planéta ako Urán (ktorému chýba vnútorný zdroj energie), toto teplo by už dávno sálalo do vesmíru. Namiesto toho, aj keď sú teploty chladné, planéta vyžaruje 2,7-krát viac tepla, ako prijíma od slnka, čo je dosť na to, aby poháňalo jej prudký vietor.