Štruktúra dvojvláknovej DNA je univerzálna vo všetkých živých bunkách, vyskytujú sa však rozdiely v metódach extrakcie genomickej DNA zo živočíšnych a rastlinných buniek. Aj keď genómová DNA žije v jadre buniek, množstvo a čistota extrahovanej DNA závisí od typu a veľkosti bunky. Napríklad niektoré bunky obsahujú viac DNA a nečistôt ako iné. Čítajte ďalej a dozviete sa viac o rozdieloch v extrakcii DNA.
Všeobecná extrakcia DNA
Ak ošetríte rastlinné a živočíšne bunky mydlovou látkou, dôjde k degradácii lipidov v bunkách a jadrových membránach. Potom sa zmes DNA oddelí od bunkových membrán a bielkovín. Ďalej môžete použiť alkohol na vyzrážanie DNA v roztoku. V závislosti od množstva vo vzorke môže byť DNA viditeľná voľným okom. Pamätajte však, že tento jednoduchý postup nemusí nevyhnutne produkovať DNA vysokej čistoty.
Rastlinné a živočíšne bunky
Rastlinné bunky sa líšia od živočíšnych vďaka svojej tuhej bunkovej stene a organelám ako chloroplast. Obsahujú tiež bielkoviny a enzýmy, ktoré zohrávajú úlohu pri fotosyntéze. Niektoré rastlinné bunky majú polyploidiu, čo znamená, že majú viac ako jednu kópiu každého chromozómu na bunku. Okrem toho bunkové procesy prebiehajúce v rastlinách, ako napríklad fotosyntéza, produkujú celý rad sekundárnych metabolitov. Živočíšne bunky nemajú bunkovú stenu, ale stále potrebujú chemikálie, ako je dodecylsulfát sodný (SDS), aby narušili bunkovú membránu a uvoľnili genómovú DNA.
Extrakcia rastlinnej DNA
Genómovú DNA rastlín je ťažšie extrahovať kvôli bunkovej stene rastliny. Môžete ho odstrániť homogenizáciou alebo pridaním celulázy, aby sa degradovala celulóza, ktorá tvorí bunkovú stenu. Metabolity prítomné v rastlinnej bunke môžu navyše interferovať s extrakciou genomovej DNA kontamináciou vzorky DNA počas procesu zrážania.
Extrakcia živočíšnej DNA
Leukocyty v periférnej krvi sú hlavným zdrojom genómovej DNA zvieraťa, ale odber vzoriek je ťažký, pretože krv musí pochádzať priamo zo zvieraťa. Krv obsahuje celý rad zlúčenín, ako sú proteíny, lipidy, biele krvinky, červené krvinky, krvné doštičky a plazma, ktoré môžu kontaminovať vzorku DNA. Avšak primárnym kontaminantom živočíšnej DNA extrahovanej zo vzoriek krvi je hem, ktorý je neproteínovou zložkou hemoglobínu.
Rozdiely v DNA
Rozdiely medzi rastlinnou a živočíšnou DNA spočívajú v postupnosti báz v špirále. Zlúčeniny nachádzajúce sa v rastlinných bunkách v živočíšnych bunkách chýbajú a odrážajú to sekvencie báz DNA. Genómová rastlinná DNA je tiež často väčšia ako živočíšna DNA. Tieto rozdiely tiež ovplyvňujú extrakčné metódy, výťažok a čistotu DNA.