Znečistenie životného prostredia zahŕňa zvýšené množstvo uhlíka a iných chemikálií vo vzduchu, odtok poľnohospodárskych živín, farmaceutické látky odpad vo vodných systémoch, úniky zo skládok, nádrže s ľudskými výkalmi, odpad v suchozemských a vodných systémoch a všetko v medzi. Aj keď je ľahké vidieť vplyv koša na veľké zvieratá, potenciálne škodlivé účinky na genetiku sú zväčša nezistené. S nástupom geneticky modifikovaných rastlín a zvierat sa navyše objavuje genetické znečistenie modifikovanými organizmami do prirodzenej populácie.
Genetická diverzita a mutácie
Ukázalo sa, že chemické znečisťujúce látky, ktoré sa dostanú do systémov zvierat, spôsobujú priame zmeny genetickej rozmanitosti. Jedna štúdia napríklad zistila expozíciu ťažkým kovom z hút vo Fínsku a Rusku, ako aj rádioaktívnym izotopom z jadrového spracovania rastlina v Rusku spôsobí zvýšenie genetickej diverzity divých populácií sýkorky veľkej a nepriaznivý pokles populácií pied muchárik. Znečistenie ovzdušia pochádzajúce z oceliarní v Hamiltone v Ontáriu do životného prostredia súvisí so zvýšením rýchlosti genetických mutácií u potomkov čajok aj myší. Tieto výsledky nie sú lokalizované. Podobné štúdie po jadrovej havárii v Černobyle hlásili zvýšenú mieru mutácií v populáciách vtákov a hlodavcov. Ťažké kovy súvisia s poškodením DNA v populáciách vtákov a cicavcov, čo preukázalo zvýšený počet génových mutácií v priemyselných oblastiach. U týchto druhov sa nezaznamenali nijaké zmeny fyzického stavu, správania alebo prežitia; ale účinky boli lokalizované iba pre niekoľko generácií.
Asymetria
Znečistenie životného prostredia spôsobuje u zvierat množstvo fyzických problémov vrátane zvýšeného výskytu chorôb, ako je rakovina, a zmenených hladín hormónov a reprodukcie; hoci tieto neboli spojené s genetickou zmenou. Od konca 80. rokov sa telesná symetria používa ako indikátor genetickej a vývojovej pravidelnosti. Asymetria je fyzická zmena, ktorá signalizuje genetickú abnormalitu. U pstruhov, myší a vtákov vedie znečistenie životného prostredia k asymetrii vo forme zväčšených fyzických znakov na jednej strane tela. Asymetria sa vyskytuje vo všetkých častiach tela, ale skôr v znakoch, ako sú ozdoby, ktoré sa používajú na prilákanie kamarátov. V lastovičkách a zebrách pinkách sa vtáky s asymetrickými ozdobami reprodukujú menej a ich potomstvo má nižšiu mieru prežitia. U znakov, ktoré neovplyvňujú reprodukciu, ako je veľkosť chodidla u veveričiek a myší a veľkosť plutiev u pstruhov, spôsobuje asymetria zvýšenú náchylnosť k predátorom a zníženie prežitia. Geneticky asymetria tiež naznačuje zníženú genetickú diverzitu vedúcu k neschopnosti primerane reagovať na stres.
Genetické znečistenie
Genetické znečistenie nastáva, keď sa voľne žijúce populácie zmiešajú s geneticky modifikovanými organizmami alebo sú nimi ovplyvnené. V prípade plodín divoká populácia vyhynie, ak je vyčerpaná tými, ktoré boli upravené tak, aby boli odolné voči chemikáliám a konzumácii hmyzom. Druhy hmyzu tiež lokálne vyhynuli a vykazujú vyššiu mieru mutácií pri kŕmení plodinami, ktoré sú geneticky modifikované na produkciu insekticídov. To naznačuje, že u iných, väčších bylinožravcov sa môžu vyskytnúť mutácie a zmenené prežitie. Baktérie žijúce na geneticky modifikovaných plodinách v Indii preukázali zvýšenú odolnosť voči antibiotikám, z ktorých jedna sa prevažne používa na liečbu tuberkulózy v regióne. So zvyšovaním bakteriálnej rezistencie by to mohlo spôsobiť zvýšenie šírenia chorôb v ľudskej populácii. Genetické znečistenie môže nastať aj pri párení divých a modifikovaných organizmov, pri ktorých sa vytvárajú hybridy. K tomu došlo v USA, Indii a v celej Európe s rastlinami od horčice po okrúhlice, reďkovky, repka olejná a ďalšie, ale dôsledky týchto genetických zmien pre prirodzené populácie ešte nie sú viditeľné.
Genetická citlivosť a vývoj
Niektoré populácie zvierat sú citlivejšie ako iné vystavenie účinkom znečistenia. Zvýšená náchylnosť sa prejaví vo forme častejších chorôb a zníženej miery reprodukcie. Tieto účinky sa môžu kombinovať a spôsobiť konečné vyhynutie miestnych, náchylných populácií. U myší bola náchylnosť na znečistenie ozónom spojená s rovnakým chromozómom ako náchylnosť na častice síry. To naznačuje zvýšenú pravdepodobnosť lokalizovaného vyhynutia u náchylných populácií.
Mikrobiálne genetické účinky
Znečistenie životného prostredia spôsobilo v mikrobiálnej komunite množstvo genetických účinkov, od antibiotickej a protiplesňovej rezistencie po zvyšovanie mikrobiálnej rozmanitosti. Zvýšené množstvo farmaceutík vo vodných systémoch vedie k tomu, že mikróby sa stanú rezistentnými voči širšej triede antimikrobiálnych liekov. Napríklad E. Ukázalo sa, že coli izolované z Shipyard Creek v Južnej Karolíne, ktoré boli znečistené toxickými kovmi a inými priemyselnými odpadmi, sú rezistentné na deväť rôznych druhov antibiotík. Keď sa mikróby v prostredí menia a potenciálne rastú virulentnejšie a patogénnejšie, zmení sa aj ich účinok na zvieratá, s ktorými prichádzajú do styku.