Protisti a baktérie patria do rôznych domén života, eukaryotov a prokaryotov, ktoré sú sunuté dlhými vekmi evolúcie. Rovnako ako všetky formy života na Zemi však majú spoločného predka, a teda existuje množstvo zaujímavých podobností. Napriek neuveriteľnej rozmanitosti protistov aj baktérií môžete urobiť niekoľko zovšeobecnení o tom, čo majú spoločné.
Genetický kód
U protistov, baktérií a všetkých ostatných organizmov určité sekvencie chemických párov báz v DNA kódujú určité aminokyseliny. Tento kód je takmer univerzálny v tom zmysle, že rovnaká sekvencia z DNA bude kódovať rovnakú sekvenciu aminokyselín tak v protistovi, ako aj v baktérii. Výnimky z tejto univerzálnosti zahŕňajú skutočnosť, že niektoré baktérie používajú sekvenciu UAG na kódovanie pyrolyzínu skôr ako na stop kodón, ktorý sa používa v iných organizmoch. Tento kód je však z veľkej časti pozoruhodnou podobnosťou medzi baktériami a protistami.
Ribozómy
Baktérie aj protisti najskôr prepisujú časti svojho kódu DNA na RNA, potom pomocou vhodných štruktúr nazývaných ribozómy preložia túto RNA na proteín. Protisti a baktérie opäť zdieľajú tieto podobnosti so všetkými ostatnými známymi formami života. Štruktúra ribozómu sa medzi baktériami a eukaryotmi, ako sú proteíny, trochu líši. Tento rozdiel je tiež dôležitý, pretože niektoré antibiotiká ničia baktérie využívaním rozdielov medzi bakteriálnymi a eukaryotickými ribozómami.
Bunkové membrány
Baktérie aj protisti majú bunkové membrány vyrobené z chemikálií nazývaných fosfolipidy. Fosfolipid v baktérii alebo v proteíne má na jednom konci skupinu rozpustnú vo vode a chvost nerozpustný vo vode. na druhej strane, takže bunkové membrány baktérií a proteínov sú vyrobené z dvojvrstvy fosfolipidy. Chvosty obidvoch smerujú k stredu dvojvrstvy. Baktérie však majú okrem svojej bunkovej membrány aj bunkovú stenu a niektoré baktérie majú vnútornú aj vonkajšiu membránu.
Vysoko konzervované procesy
Baktérie a protisti majú spoločné nápadné podobnosti v rôznych biochemických procesoch, ktoré sú tiež veľmi podobné tým vo všetkých ostatných formách života. Proces, ktorý používajú baktérie a protisti na odbúravanie glukózy, sa nazýva glykolýza. Aj keď existujú určité variácie, glykolýza prebieha takmer vo všetkých známych organizmoch. Rovnako aj proces replikácie DNA je medzi baktériami a protistami veľmi podobný, s malými rozdielmi.