Je dôležité po každom použití podložné sklíčka dôkladne vyčistiť, pretože inak riskujete kontamináciu podložných sklíčok pri ďalšom použití. Bity vzorky, ktoré použijete na tejto snímke, sa môžu zmiešať so vzorkou použitou na nasledujúcej snímke a zničiť ju. Našťastie správne vyčistenie diapozitívov vyžaduje len malé úsilie.
Na každé podložné sklíčko mikroskopu vložte malú kvapku čistiaceho roztoku. Môže to byť tekutina na umývanie riadu alebo to môže byť špecializovanejší čistiaci roztok na podložné sklíčka, napríklad roztok etylalkoholu.
Mydlo nanášajte rovnomerne na obe strany pohára pomocou niečoho, čo nepoškriabe podložné sklíčko, napríklad utierkou z mikrovlákien, ktorá nepúšťa vlákna.
Sklíčko dôkladne opláchnite teplou tečúcou vodou. Pokračujte, kým nezmizne všetka čistiaca kvapalina vrátane akýchkoľvek ďalších bubliniek, ktoré sa objavia.
Blokujte sklíčko papierovou utierkou, kým nie je suchá. Prípadne môžete sklíčka vysušiť uterákmi z mikrovlákna. Uistite sa, že uterák, ktorý používate, je pre každú novú podložku čistý. Možno budete musieť po určitom počte snímok prejsť na nový uterák.
Vložte každú hotovú sklíčko späť do puzdra na sklíčka. Každé puzdro bude zvyčajne obsahovať 25 diapozitívov. Uistite sa, že každá snímka zapadne na správne miesto. Ak sa pokúsite puzdro preťažiť viacerými snímkami, ako je možné, mohli by sa podložky o seba naraziť a prasknúť.
Šmykľavky nechajte v umývadle celý deň. To by mal byť dostatok času na to, aby sa mohla uvoľniť krv, olej alebo iný materiál.
Pomocou gázy potierajte každé sklíčko jednotlivo z oboch strán, kým nie sú čisté. Dajte pozor, aby ste tobogany nechali vo vode nanajvýš niekoľko dní. Ak necháte sklíčka vo vode s čistiacim prostriedkom niekoľko týždňov alebo dlhšie, riskujete, že sa voda nechá odpariť. Na podložných podložkách tak zostanú zvyšky čistiaceho prostriedku, ktoré sa budú ťažko odstraňovať.
Očistené diapozitívy zabaľte do listov čistého papiera, kým nie sú pripravené na ďalšie použitie. To vám umožní uložiť snímky bližšie k sebe, ak puzdro nie je k dispozícii. Uchovajte podložné sklíčka niekde na suchu. Ak tak neurobíte, snímky sa kvôli vlhkosti zlepia. Sklíčka potom budete musieť pred použitím znova umyť, pretože by mohli byť kontaminované vlhkým vzduchom.