Ako vypočítať izoelektrický bod peptidov

Peptidy sú krátke polymérne fragmenty zložené z aminokyselín. Každý peptid má určitú aminokyselinovú sekvenciu označenú trojpísmenovým alebo jednopísmenovým kódom; napríklad aminokyselina alanín je skrátená ako „Ala“ alebo „A.“ Náplň peptidov v roztoku závisí od kyslosti roztoku. Izoelektrický bod (pl) sa týka hodnoty kyslosti roztoku, pri ktorej má peptidová molekula čistý náboj nula. Rozpustnosť peptidu je v izoelektrickom bode minimálna. Použite dostupné webové servery na výpočet hodnoty pI pre peptidovú aminokyselinovú sekvenciu.

Píšte peptidovú sekvenciu pomocou jednopísmenového kódu. Napríklad, ak má peptid aminokyselinovú sekvenciu Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (alanín-serín-kyselina glumatická-leucín-prolín), potom je postupnosť jedného písmena „ASELP“. Ak je to potrebné, pozrite si konverznú tabuľku z troch písmen na jedno písmeno uvedenú v Zdroje.

Na navigáciu na server, ktorý počíta izoelektrický bod peptidu (pI), použite ľubovoľný webový prehliadač, napríklad Internet Explorer alebo Firefox; pozri zdroje.

Prečítajte si hodnotu izoelektrického bodu (pI) uvedenú v riadku „Teoretická hodnota pI / Mw“. V našom príklade je pi 4,00. Server tiež počíta molekulovú hmotnosť (Mw) peptidu.

O autorovi

Oxana Fox je nezávislá spisovateľka špecializujúca sa na medicínu a liečbu, počítačový softvér a hardvér, digitálnu fotografiu a finančné služby. V roku 1988 absolvovala Moskovskú lekársku fakultu s pediatrickým vzdelaním.

Fotoúvery

Comstock Images / Comstock / Getty Images

  • Zdieľam
instagram viewer