În secolul al XIX-lea, taxonomia - clasificarea organismelor vii - era la modă în biologie. Atât naturaliștii amatori, cât și profesioniștii erau atât de prinși în nebunia de a colecta și identifica creaturi, încât gândacii rari erau mărfuri fierbinți. La acea vreme, se știau puține despre microorganisme și locul lor în lumea viețuitoarelor, iar clasificarea microbiologiei nu a primit atât de multă atenție. În deceniile care au urmat au fost observate o creștere dramatică a cunoașterii microbilor și a metodelor de identificarea microorganismelor, cu o parte din această creștere demonstrată de clasificarea eficientă a microorganisme.
Componentele taxonomiei
Taxonomia are trei componente: nomenclatură, clasificare și identificare. Nomenclatura este pur și simplu atribuirea unui nume unei specii. Clasificarea grupează speciile în funcție de caracteristicile comune - dintre care unele sunt fizice, iar altele biochimice. Identificarea utilizează trăsăturile unui organism pentru a determina unde aparține într-o schemă de clasificare. Schema taxonomică modernă are ca grup cel mai mare, cel mai inclusiv, domeniile. Cel mai mic grup este specia. De la cele mai incluzive la cele mai specifice, nivelurile rulează astfel: domeniu, regat, filum, clasă, ordine, familie, gen și specie. Tu, de exemplu, ești Eukarya Animalia Chordata Mammalia Primate Hominidae Homo sapiens.
Microorganisme și domenii
Microorganismele sunt extrem de diverse. Ele nu sunt definite de un anumit tip de structură sau funcție, ci pur și simplu de mărimea lor. Microorganismele sunt atât de scufundătoare încât se încadrează în toate cele trei clasificări de nivel superior - toate cele trei domenii. Un domeniu este bacteriile, celălalt este archaea, iar finalul este eukarya. Toți membrii domeniilor bacterii și arhee sunt microorganisme unicelulare. Ambele sunt celule fără membrane care își separă materialul genetic de restul celulei - membrane care definesc un nucleu. Deci, toate regatele, filele, clasele, ordinele, familiile, genurile și speciile din domeniile bacteriilor și arheilor sunt microorganisme.
Protiști unicelulari
Eukarya sunt organisme ale căror celule conțin un nucleu. Multe organisme eucariote sunt microorganisme unicelulare, dar multe altele - cum ar fi copacii de sequoia sau voi - nu sunt. Deci sunt necesare clasificări suplimentare. Regatul Protista din domeniul Eukarya este compus doar din microorganisme unicelulare. Protistele sunt separate în trei grupuri diferite de filuri: patru filuri diferite de alge, patru filuri diferite de protozoare și două filuri diferite de mucegai. Dar toate organismele din aceste filme - toate din regatul Protista - sunt microorganisme.
Ciuperci microscopice
Regatul Ciuperci este cuprins în domeniul Eukarya. Unele filuri din ciuperci conțin microorganisme. De exemplu, filumul Zygomycota conține matrițe microscopice pentru pâine, iar filul Ascomycota conține drojdii și dăunători și paraziți ai culturilor microbiene. Lichenii sunt un ansamblu simbiotic al unei ciuperci și al unui organism fotosintetic - conținut parțial în regatul Ciuperci și parțial în alte regate sau chiar în alte domenii.