O alelă este o posibilă secvență codificatoare a unei gene. O concepție greșită obișnuită sau o terminologie defectuoasă este că există gene pentru trăsături specifice. Genele controlează diferite trăsături ale unui organism, cum ar fi culoarea părului sau culoarea ochilor, dar expresia reală a unei trăsături depinde de care alelă este dominantă. De exemplu, gena pentru culoarea ochilor la om poate avea o alelă pentru ochii căprui și o alelă pentru ochii albaștri, sau o alelă pentru ochii căprui și una pentru ochii verzi. Oamenii, precum și alte forme de viață care au două copii ale fiecărui cromozom, au, de asemenea, două copii ale fiecărei gene pentru a stoca alele.
Cele două copii ale unei gene, una pe fiecare dintre cromozomi, conțin fiecare o alelă. Homozigoza apare atunci când cele două copii ale genei conțin aceeași alelă pentru un anumit fenotip sau trăsătură exprimată. Heterozigoza apare atunci când cele două alele sunt diferite. Fenotipurile pot fi fie dominante, fie recesive. Dacă un fenotip este dominant, trebuie să fie prezent doar una dintre alelele pentru acesta. Dacă este recesiv, ambele alele trebuie să fie prezente.
Potrivit Biroului de Stat al Educației din Utah, un pătrat Punnett poate fi utilizat pentru a prezice probabilitatea că un anumit genotip va apărea la descendenți prin luarea alelelor celor doi părinți și combinarea lor. Genotipul va influența fenotipul, în funcție de faptul dacă alelele sunt dominante sau recesive. Pătratul de bază Punnett este împărțit în patru pătrate mai mici. Posibilele gene ale unui părinte sunt enumerate deasupra celor două pătrate superioare, celălalt de lângă acesta mergând vertical în partea stângă. Literele majuscule denotă alele dominante, iar literele minuscule denotă alelele recesive. De exemplu, o genă homozigotă dominantă pentru ochii căprui ar fi scrisă ca BB, iar una heterozigotă ca Bb. O genă recesivă homozigotă ar fi scrisă ca bb. Luând literele adiacente fiecărui pătrat, pentru o cruce Bb x Bb, probabilitatea unui genotip BB ar fi de 25%, Bb 50% și bb 25%. În ceea ce privește fenotipul, descendenții au șanse de 75 la sută de a avea ochi căprui, deoarece ochii căprui sunt un fenotip dominant, conform sciencekidsathome.com.