Foarte puține bacterii produc endospori. Doar unele dintre aceste specii din filul Firmicute produc endospori, care sunt structuri nereproductive care conțin ADN și o porțiune a citoplasmei. Endosporii nu sunt spori adevărați, deoarece nu sunt descendenți ai bacteriei. Endosporii se formează atunci când bacteriile sunt supuse unor condiții de mediu extreme sau nefavorabile. Pot supraviețui perioade lungi chiar și atunci când sunt înfometați de alimente și atunci când sunt expuși la substanțe chimice și temperaturi care ar ucide în mod normal bacteriile.
Bacterii Bacillus
Bacteriile din genul Bacillus sunt cele mai frecvent studiate dintre toate bacteriile producătoare de endospori. Bacilele bacteriene sunt diverse și prosperă în multe medii diferite. Endosporii acestei bacterii sunt extrem de toxici pentru multe organisme, inclusiv pentru oameni. Agentul patogen Bacillus anthracis este o toxină bine cunoscută care a fost utilizată atât de oamenii de știință, cât și de teroriști. Cu toate acestea, există multe alte specii de Bacillus.
Bacteriile Clostridium
La fel ca alte specii de bacterii producătoare de endospori, bacteriile Clostridium sunt gram-pozitive, indicând faptul că au caracteristici similare, cum ar fi structura peretelui celular. Bacteriile gram-pozitive sunt sensibile la aceleași sau la antibiotice înrudite. Bacteriile din genul Clostridium sunt responsabile pentru o gamă largă de boli umane, de la intoxicații alimentare ușoare la botulism, precum și tetanos și gangrenă gazoasă.
Desulfotomaculum Bacterii
Similar cu alte bacterii producătoare de endospori, bacteriile din genul Desulfotomaculum sunt, de asemenea, responsabile pentru deteriorarea și boala alimentelor. Bacteriile Desulfotomaculum pot provoca stricarea alimentelor slab conservate. Acolo unde sunt din abundență, produc un miros neplăcut asemănător sulfului.