O principal efeito da destruição do habitat é a redução da biodiversidade, que se refere à variedade e abundância de diferentes espécies de animais e plantas em um determinado ambiente. Quando um animal perde o lar ou habitat natural de que precisa para sobreviver, seu número diminui rapidamente e ele caminha para a extinção. Estima-se que 14.000 a 35.000 espécies estão em risco de extinção, e a destruição do habitat é uma das principais causas.
Polinização e dispersão de sementes
Tanto as plantas selvagens quanto as agrícolas dependem da polinização para a reprodução. Frutas e vegetais, componentes essenciais da dieta humana, dependem das abelhas e de outros insetos para transferir o pólen de uma flor para outra. Quando a destruição do habitat reduz as variedades desses polinizadores, os rendimentos das colheitas também caem. Por exemplo, as abelhas sem ferrão na Costa Rica que nidificam apenas em florestas aumentam em 20 por cento o rendimento das plantações de café localizadas perto de fragmentos florestais. Muitas plantas também dependem de animais, especialmente aqueles que comem frutas, para a dispersão de sementes. Destruir o habitat de animais desse tipo pode afetar gravemente as espécies de plantas que deles dependem.
Regulamento do Clima
A biodiversidade afeta o clima principalmente por meio da regulação da quantidade de dióxido de carbono na atmosfera. A destruição de habitats florestais reduz a capacidade das florestas de absorver dióxido de carbono. A taxa de crescimento e o grau de madeira de uma planta determinam a taxa de renovação do carbono dentro dela. Os padrões da paisagem também são importantes, uma vez que o sequestro de carbono é reduzido nas bordas dos fragmentos florestais. Os ecossistemas marinhos também desempenham um papel significativo no sequestro de carbono.
Controle de pragas e doenças
As pragas geralmente têm como alvo tipos específicos de plantas. Quando os habitats são destruídos e a diversidade das plantas é reduzida, o ambiente contém mais de um tipo particular de planta. Isso torna mais fácil para as pragas se espalharem. A diversidade de plantas fornece habitats para uma maior variedade de insetos e outros animais e para os inimigos naturais de pragas. As doenças fúngicas das plantas são mais graves em áreas de monocultura onde um único tipo de cultura está sendo cultivado.
Efeitos indiretos
A produção de alimentos, roupas e abrigo para humanos depende de muitas maneiras indiretas da biodiversidade dos ecossistemas. Uma grande diversidade de safras agrícolas protege os agricultores contra quebras de safra. A destruição de habitats e a redução da diversidade de espécies podem tornar os ecossistemas mais vulneráveis a espécies invasoras e afetar indiretamente a saúde e o bem-estar humanos. O efeito das espécies invasoras é ilustrado pelo que aconteceu quando o bass foi introduzido no Lago Gatún, no Panamá. A presença do robalo resultou na redução de predadores de larvas de mosquitos e no aumento da incidência de malária.