Como a maioria dos biomas da Terra, o ecossistema da savana sobrevive em um equilíbrio delicado entre fatores ambientais e várias espécies, incluindo humanos. A seca severa pode roubar essas pastagens de sua água e folhagem vitais, enquanto os caçadores furtivos e povos indígenas costumam ameaçar perturbar a teia alimentar matando animais por esporte ou sobrevivência.
Atividades humanas
As atividades humanas podem ameaçar seriamente perturbar os ecossistemas da savana. O uso não sustentável da água e os métodos de irrigação podem potencialmente secar rios e poços vitais. Em regiões onde os indígenas incluem regularmente carne de caça - carne selvagem - em sua dieta, as populações de ungulados caíram em taxas perceptíveis. Alguns animais selvagens da savana também são caçados como troféus; os rinocerontes negros, em particular, são caçados por seus valiosos chifres. Mesmo algumas espécies de plantas são colhidas em excesso devido ao seu valor comercial. As esculturas feitas de madeira negra africana, uma árvore da savana, costumam ser vendidas nos mercados de turistas.
Seca e Pastoreio Pesado
A seca severa e prolongada tem um efeito perigoso no ecossistema de savana, com os padrões de pastoreio exacerbando esse efeito. A combinação de seca severa e pastoreio pode transformar uma pastagem de gramíneas perenes principalmente comestíveis em uma savana dominada por gramíneas e plantas não comestíveis. Pastagens levemente pastadas mantêm sua qualidade de espécies de gramíneas perenes e palatáveis, mas a composição das espécies de plantas ainda pode ser alterada. Especialistas pedem soluções de manejo de pastagem durante episódios de seca para afetar a direção da mudança potencial em direção à sustentabilidade das pastagens.
Desertificação
As savanas tropicais costumam fazer fronteira com regiões áridas e desérticas, e a disseminação de condições desérticas em áreas de pastagens secas é chamada de desertificação. Esta ameaça ao ecossistema de savana inclui efeitos causados por mudanças climáticas, práticas agrícolas, sobrepastoreio, irrigação agrícola agressiva, que reduz o nível do lençol freático longe das raízes das plantas, desmatamento e erosão. A cada ano, mais de 46.000 quilômetros quadrados de savana africana tornam-se desertos. O plantio de plantas resistentes à seca pode estabilizar as dunas de areia inconstantes e iniciar a proliferação de vegetação adicional.
Emissões de carbono
Uma pesquisa de 2012 atribuiu grandes aumentos na massa da planta lenhosa ao "efeito da fertilização com CO2". Os autores postulou que o aumento na taxa de crescimento das plantas lenhosas foi causado pelo aumento do carbono atmosférico dióxido. Um aumento dramático na quantidade de árvores e arbustos pode ameaçar todo o ecossistema da savana, já que essas plantas usam mais água do que gramíneas. Conservacionistas na Namíbia têm relatado que as plantas lenhosas têm impedido os antílopes e as chitas que os caçam - um desenvolvimento que pode ter repercussões desconhecidas em todo o pastagens.