Conhecida por sua biodiversidade, a Malásia abriga 15.000 plantas com flores. No entanto, a flora e a fauna do país estão sob grave ameaça e sofreram um esgotamento de 70 por cento do crescimento original. De acordo com a Lista Vermelha da União Internacional para a Conservação da Natureza (IUCN), a Malásia tem 686 espécies de plantas ameaçadas de extinção em 2007. As leis da Malásia protegem pássaros, mamíferos e insetos. A flora e a fauna são protegidas apenas se crescerem dentro de um parque ou reserva nacional.
Os principais tipos de floresta na Malásia são Giam Kanching ou floresta rara de dipterocarpo, floresta de mangue, floresta de pântano de turfa e floresta ericácea montana, de acordo com o Worldwide Wildlife Fund. A árvore dipterocarpo, conhecida por seus frutos com sementes de duas asas, cresce em terras logo acima do nível do mar a uma altitude de aproximadamente 900 metros. As florestas de dipterocarpo de planície, que são encontradas até 300 metros acima do nível do mar, foram dizimadas devido à agricultura e outras atividades intensivas em terra. Enquanto um bolsão de árvores dipterocarp é protegido na Reserva Florestal Kanching, esta espécie é considerada criticamente ameaçada de extinção - à beira da extinção - na Lista Vermelha.
Esta planta tropical carnívora cresce apenas em florestas musgosas a uma altitude de 2.000 a 2.600 metros no Monte Trus Madi em Bornéu. A Nepenthes macrophylla tem folhas em forma de jarro que pendem de vinhas de dez metros de comprimento. Os insetos deslizam do topo ceroso da flor para uma poça de ácido secretado pelas glândulas na parte inferior da flor, de acordo com a ASEAN Review of Biodiversity & Environmental Conservation. A Lista Vermelha da IUCN classificou o Nepenthes macrophylla como criticamente ameaçado.
Considerado criticamente em perigo na Lista Vermelha, Taxitheliella richardsii é um musgo da família Sematophyllaceae e nativo da Malásia. A única área conhecida (menos de 10 km²) onde o musgo foi encontrado é em Sarawak, um estado da Malásia no noroeste de Bornéu. Taxitheliella richardsii cresce em videiras lenhosas e toras apodrecidas em florestas subtropicais, um habitat que está desaparecendo devido à colheita e extração de madeira.