Struktura dwuniciowego DNA jest uniwersalna we wszystkich żywych komórkach, ale różnice występują w metodach ekstrakcji genomowego DNA z komórek zwierzęcych i roślinnych. Chociaż genomowy DNA żyje w jądrze komórkowym, ilość i czystość wyekstrahowanego DNA zależy od typu i wielkości komórki. Na przykład niektóre komórki zawierają więcej DNA i zanieczyszczeń niż inne. Czytaj dalej, aby dowiedzieć się więcej o różnicach w ekstrakcji DNA.
Ogólna ekstrakcja DNA
Jeśli potraktujesz komórki roślinne i zwierzęce substancją mydlaną, spowoduje to degradację lipidów w błonach komórkowych i jądrowych. Następnie mieszanina DNA oddzieli się od błon komórkowych i białek. Następnie możesz użyć alkoholu do wytrącenia DNA w roztworze. W zależności od ilości w próbce, DNA może być widoczne gołym okiem. Należy jednak pamiętać, że ta prosta procedura niekoniecznie daje DNA o wysokiej czystości.
Komórki roślinne i zwierzęce
Komórki roślinne różnią się od komórek zwierzęcych sztywną ścianą komórkową i organellami, takimi jak chloroplast. Zawierają również białka i enzymy, które odgrywają rolę w fotosyntezie. Niektóre komórki roślinne mają poliploidalność, co oznacza, że mają więcej niż jedną kopię każdego chromosomu na komórkę. Ponadto procesy komórkowe zachodzące w roślinach, takie jak fotosynteza, wytwarzają szereg metabolitów wtórnych. Komórki zwierzęce nie mają ściany komórkowej, ale nadal potrzebują substancji chemicznych, takich jak dodecylosiarczan sodu (SDS), aby rozerwać błonę komórkową w celu uwolnienia genomowego DNA.
Ekstrakcja DNA roślin
Genomowy DNA roślin jest trudniejszy do ekstrakcji ze względu na ścianę komórkową rośliny. Można go usunąć przez homogenizację lub przez dodanie celulazy w celu degradacji celulozy, z której składa się ściana komórkowa. Ponadto metabolity obecne w komórce roślinnej mogą zakłócać ekstrakcję genomowego DNA poprzez zanieczyszczenie próbki DNA podczas procesu precypitacji.
Ekstrakcja zwierzęcego DNA
Leukocyty krwi obwodowej są głównym źródłem genomowego DNA zwierząt, ale pobieranie próbek jest trudne, ponieważ krew musi pochodzić bezpośrednio od zwierzęcia. Krew zawiera szereg związków, takich jak białka, lipidy, krwinki białe, krwinki czerwone, płytki krwi i osocze, które mogą zanieczyścić próbkę DNA. Jednak głównym zanieczyszczeniem zwierzęcego DNA wyekstrahowanego z próbek krwi jest hem, który jest niebiałkowym składnikiem hemoglobiny.
Różnice DNA DNA
Różnice między DNA roślinnym a zwierzęcym tkwią w sekwencji zasad w helisie. Związki znajdujące się w komórkach roślinnych są nieobecne w komórkach zwierzęcych, a sekwencje zasad DNA to odzwierciedlają. Ponadto genomowy DNA roślinny jest często większy niż DNA zwierzęcy. Różnice te wpływają również na metody ekstrakcji, wydajność i czystość DNA.
