Proces wytwarzania białka z sekwencji DNA – kwasu dezoksyrybonukleinowego – obejmuje dwa główne etapy: transkrypcję i translację. Podczas transkrypcji z matrycy DNA tworzony jest informacyjny kwas rybonukleinowy lub mRNA. Ten mRNA łączy się z rybosomalnym RNA, znanym jako rRNA, i przenoszący RNA lub tRNA, złożony w celu przełożenia kodu mRNA na sekwencję aminokwasową, białko. DNA składa się z sekwencji zasad nukleotydowych. Cztery zasady to adenina, tymina, guanina i cytozyna. Sekwencja, w której te zasady występują na nici DNA, ostatecznie koduje produkcję niektórych białek. Po wytworzeniu przez komórkę białek mogą one być wykorzystywane strukturalnie lub w różnych procesach metabolicznych.
Utwórz transkrypt mRNA sekwencji DNA. Każda zasada w DNA pasuje do innej zasady. Zdjęcia DNA zazwyczaj pokazują go w postaci podwójnej helisy, z zasadami na jednej nici połączonymi wiązaniami z komplementarnymi zasadami na przeciwległej nici. Zasady uzupełniające to: adenina (A) i tymina (T) oraz cytozyna (C) i guanina (G). Więc jeśli jedna nić DNA czyta A-C-G-C-T-A, to nić komplementarna to T-G-C-G-A-T. Sekwencję transkryptu mRNA można znaleźć w ten sam sposób, używając dopełnień zasad pokazanych w sekwencji DNA. RNA nie zawiera jednak zasady tyminy (T); zamiast tego podstawa ta jest zastąpiona uracylem (U). Kiedy natrafisz na adeninę (A) w sekwencji DNA, połącz ją z uracylem (U).
Jeśli sekwencja DNA to A-A-T-C-G-C-T-T-A-C-G-A, to sekwencja mRNA to U-U-A-G-C-G-A-A-U-G-C-U.
Utwórz sekwencję antykodonu tRNA z transkryptu mRNA. Każde tRNA ma zestaw trzech zasad, znanych jako antykodon. Antykodon pasuje do komplementarnych zasad w sekwencji mRNA. Aby określić całkowitą sekwencję anty-kodonu, która będzie pasować do nici mRNA, po prostu dokonaj ponownej transkrypcji sekwencji RNA; innymi słowy, wypisz uzupełniające się podstawy. Stosując wcześniej odnotowaną sekwencję mRNA, sekwencją antykodonową tRNA jest A-A-T-C-C-C-U-U-A-C-G-A.
Podziel znalezioną sekwencję tRNA na zestawy składające się z trzech zasad. Ponieważ antykodon składa się z trzech zasad na raz, lepszym sposobem zapisania sekwencji antykodonu A-A-T-C-C-U-U-A-C-G-A jest AAT-CGC-UUA-CGA.
Wskazówki
-
Sekwencję antykodonową można znaleźć jeszcze szybciej, po prostu wpisując sekwencję DNA, używając U dla uracylu zamiast T dla tyminy. Następnie podziel sekwencję na trzy podstawowe antykodony.
Możesz użyć sekwencji antykodonowej, aby dopasować się do białek dodawanych przez każdy tRNA podczas translacji, tworząc sekwencję aminokwasową. Sprawdź jednak, czy karta referencyjna aminokwasów, której używasz, dotyczy antykodonów (patrz Zasoby). Wiele wykresów sekwencjonowania aminokwasów po prostu wymienia pasujące kodony mRNA zamiast antykodonów tRNA, co pozwala pominąć etap określania sekwencji antykodonu.
Sekwencja cząsteczki tRNA to po prostu transkrypcja RNA sekwencji DNA użytej do jej stworzenia.