DNA ma wiele ścieżek naprawczych. Jeden musi wystąpić w świetle, a kilka może pojawić się w ciemności. Mechanizmy te różnią się tym, czy enzymy wymagane do wykonania czynności czerpią energię ze słońca.
Dwie zasady DNA mogą zostać usieciowane w obecności światła UV. To usieciowanie zapobiega występowaniu różnych procesów komórkowych, w tym replikacji DNA.
W naprawie światła enzym zwany fotoliazą tnie usieciowany DNA spowodowany uszkodzeniem przez promieniowanie UV. Fotoliaza wymaga energii słonecznej.
Ciemne reakcje wykorzystują enzym zwany N-glikozylazą do rozszczepiania wiązań krzyżowych w DNA. W szczególności N-glikozylaza nie wymaga energii słonecznej.
Naprawa rekombinacyjna to również mechanizm naprawy DNA, który nie wymaga światła. Maszyneria replikacji DNA nie może replikować się poprzez usieciowane zasady DNA. Może jednak przeskoczyć, pozostawiając lukę. Lukę tę może wypełnić przeciwny chromosom po replikacji, ale zanim nastąpi podział komórkowy. Proces ten jest znany jako rekombinacja homologiczna i nie wymaga światła.
Naprawa przez wycięcie ma miejsce, gdy usieciowane pary zasad są rozpoznawane przez kompleks białkowy, który usuwa kilka zasad rozciągających się przed i po sieciowaniu. Po usunięciu DNA jest prawidłowo replikowane przy użyciu niezniekształconej nici jako matrycy.
