Cecha abiotyczna to nieożywiony składnik ekosystemu, który wpływa na rozkwit żywych organizmów. Biomy wodne obejmują oceany, jeziora, rzeki, strumienie i stawy. Każdy zbiornik wodny, w którym żyje życie, jest biomem wodnym. Biomy wodne są gospodarzem wielu cech abiotycznych, ale są szczególnie zależne od pięciu z tych cech.
Światło słoneczne
Światło słoneczne jest niezbędne do fotosyntezy, która stanowi podstawę większości łańcuchów pokarmowych w biomach wodnych. W płytkiej wodzie ilość dostępnego światła słonecznego zależy w dużej mierze od zmieniających się czynników, takich jak pora roku, zachmurzenie i lokalna geografia. Jednak w głębokich wodach oceanu i niektórych jeziorach światło słoneczne przenika tylko ułamek drogi na dno, pozostawiając ogromne zatoki w całkowitej ciemności. Większość oceanu w ogóle nie otrzymuje światła słonecznego. Życie na tych głębokościach w dużej mierze zależy od zatapiania resztek z płytszych ekosystemów.
Temperatura
W małych zbiornikach wodnych temperatura może się znacznie wahać w ciągu dnia i nocy oraz w zależności od pory roku. Organizmy muszą być przygotowane do radzenia sobie z tymi fluktuacjami lub wymarcia. W dużych jeziorach i głębokich oceanach temperatura jest funkcją głębokości. Ponieważ światło słoneczne zmniejsza się wraz z głębokością, woda staje się zimniejsza, a temperatura w mniejszym stopniu zależy od warunków powierzchniowych. Głęboko w oceanie temperatura spada prawie do zera i pozostaje niewiarygodnie stabilna. Wyjątkiem są malutkie „wyspy” przegrzanej wody dostarczanej przez kominy wulkaniczne na dnie oceanu, które rozwijają własne, wysoce wyspecjalizowane ekosystemy.
Skład chemiczny
Dwie najważniejsze substancje chemiczne rozpuszczone w wodzie to tlen i dwutlenek węgla. Tlen jest niezbędny do utrzymania zwierząt i niektórych form glonów, podczas gdy dwutlenek węgla jest niezbędny do podtrzymania życia roślin. Jeśli równowaga między tymi dwoma chemikaliami zostanie zachwiana, rezultatem może być masowe wymieranie życia roślinnego lub zwierzęcego. Na skład chemiczny wody mają również wpływ lokalne warunki glebowe oraz spływy z działalności człowieka. Niewielki wzrost poziomu niektórych chemikaliów może być niezwykle szkodliwy dla organizmów wodnych.
Teren
Aby wykorzystać podwodny teren, wyewoluowały bardzo różne ekosystemy. Wolna rzeka z błotnistym dnem będzie schronieniem dla zupełnie innej populacji ryb niż strumień płynący szybko i czysto po skałach. Ocean jest schronieniem dla różnorodnych populacji zależnych od raf koralowych, piaszczystych brzegów, skalistych wzniesień wysp lub przestrzeni otwartego oceanu. Często gatunek w swoim cyklu życiowym będzie zależny od więcej niż jednego terenu, chociaż niektórzy są specjalistami, którzy nie mogą przetrwać poza wąskim zakresem terenów.
Zakłócenie wody
Zaburzenia wody mogą przybierać postać fal, prądów lub ruchu rzek. Wielkość zakłóceń, którym podlega zbiornik wodny, determinuje ilość tlenu i dwutlenku węgla, które są rozpuszczane z atmosfery, stratyfikację temperatury od powierzchni do większych głębokości oraz wpływ chemikaliów obecnych w woda. Spokojne jezioro będzie miało węższy i ściślej zdefiniowany zestaw warstw temperaturowych niż rozbity falami ocean, podczas gdy wymagania życia w szybko płynącej rzece różnią się od obu.