Begynn prosessen med å identifisere ukjente bakterier ved å observere deres fysiske egenskaper, som cellevegg, form og koblinger. Bruk standard laboratorieprosedyrer, som cellefarging, dyrking og DNA-sekvensering for å begrense identifikasjonen ytterligere. Bakterier er generelt gruppert i arter i henhold til deres fysiske og metabolske egenskaper, snarere enn deres genetiske forhold til hverandre.
Positiv eller negativ
Eubakterier er de såkalte sanne bakteriene. De skiller seg fra archaea eller archaebacteria, som danner et eget rike. Eubakterier er prokaryoter, noe som betyr at de mangler en kjernemembran. De fleste har cellemembraner og cellevegger. Bakterier med tykke cellevegger kalles grampositive fordi de er utsatt for å dø under en test kalt Gram-flekken. Gram-flekken er den første testen som brukes i bakterieklassifisering. Bakterier med tynne eller fraværende cellevegger er gramnegative fordi de ikke fanger Gram-flekkfargestoffet.
Forming av bakterier
Sfæriske bakterier kalles kokker, bakterier som danner rette stenger kalles baciller og bakterier med en mellomliggende form kalles coccobacilli. Disse kan alle være gram-negative eller gram-positive. Stive, spiralformede bakterier er kjent som spirilla og er bare gramnegative. Fleksible, uavhengig mobile, spiralformede bakterier kalles spiroketer og er gramnøytrale. Til slutt, stive, kommaformede stenger kalles vibrios og er gramnegative. Noen få lite kjente og dårlig forståte bakterier har forskjellige former, for eksempel den stjerneformede stella og økseformede labrys. Det er også to mellomliggende bakteriegrupper. Rickettsia ligner på virus, har en rekke former, er gramnegative og kan bare overleve i andre celler. Mycoplasma, som ligner på sopp, mangler cellevegger og inkluderer mange artsspesifikke, lungebetennelsesfremkallende lungepatogener.
Kuber, klynger og andre koblinger
Cocci og basiller klassifiseres videre etter koblingene de danner etter celledeling. Diplokokker og diplobaciller holder sammen parvis. Streptokokker og streptobaciller danner kjeder. Tetrad kokker holder seg i firkanter med fire bakterier. Sarcinae cocci danner kuber av åtte bakterier og stafylokokker danner klynger.
Identifisere bakterien
Hvis du har en ukjent bakterie, og du vil identifisere den, vil du vanligvis utføre en gram flekk og deretter observere koloniens utseende og de enkelte funksjonene. På det tidspunktet kan du si at du for eksempel har en gramnegativ, aerob streptobacilli. Du kan deretter sammenligne prøven din med forskjellige kjente bakterier ved å plassere den på forskjellige kulturmedier som oppmuntre til vekst av noen arter og hemme andre, eller ved å teste prøven for forskjellige kjente bakterier biprodukter. Som en siste utvei kan DNA-sekvensering avgjøre om du har en kjent eller ukjent bakterieart eller -stamme, forutsatt at du sammenligner den med en art eller stamme hvis genom allerede er sekvensert.