Strukturen til deoksyribonukleinsyre - DNA - ble vist å være en dobbel helix for mange år siden, men konvensjonen om å navngi hver streng har blitt et tema for forvirring for både forskere og studenter. Blant DNA-par kalles det ene Watson og det andre Crick, etter de to medoppdagerne av DNA. Men den vitenskapelige litteraturen er uenig i hvilken streng som skal gis hvilket navn. Watson-Crick-navnesystemet var ment å indikere de forskjellige funksjonelle egenskapene til hver streng i DNA-strukturen, som er det samme målet med de andre navnesystemene. Det er avgjørende å forstå de forskjellige sammenhengene der de enkelte strengene trenger å ta på seg forskjellige navn. To perfekte eksempler er deres forskjellige roller i DNA-replikasjon eller transkripsjon. Å vite hva hver streng gjør i en biologisk prosess, vil bidra til å avklare hvorfor den ble gitt det navnet.
Anti-Sense er ikke tull
Transkripsjon er prosessen med å kopiere DNA til RNA. Det gjøres av et enzym kalt RNA Polymerase (RNA Pol). RNA Pol leser bare en av de to DNA-strengene ettersom den lager RNA-molekylet. Det dobbeltstrengede DNA-molekylet er delt fra hverandre, og RNA Pol binder til en streng, som den vil lese og kopiere. Denne strengen kalles malstrengen, eller antisense-strengen. RNA-molekylet som produseres vil være komplementært til malstrengen, noe som betyr nukleotidene til malstreng og RNA-molekyl samsvarer med hverandre i henhold til reglene: adenin til uracil, og guanin til cytosin.
Denne gir mening
Når RNA blir transkribert fra DNA, binder RNA Polymerase til og kopierer malstrengen. Den gjenværende strengen kalles den kodende strengen (se referanse 5), eller sense-strengen. Gitt baseparringsreglene for nukleinsyrer (A-par med T og G-par med C), har kodingen, eller sense, DNA-streng en identisk sekvens som den som produseres av RNA. Unntaket her er at RNA inneholder nukleotidet U (uracil) i stedet for T (tymin), som begge pares med A (adenin).
Smooth Ride
Før mitose, eller celledeling, må cellen replikere sitt DNA slik at hver dattercelle vil ha et identisk antall DNA-tråder. DNA-polymerase er enzymet som kopierer lange strekninger av DNA til mer DNA. Ved replikasjonsgaffelen glir DNA-molekylet ut for å danne en boble som Polymerase glir inn i. Polymerase binder seg til begge strengene av det oppviklede DNA og begynner å lage kopier av begge trådene. En av kopiene er laget som en enkelt kontinuerlig streng, som blir referert til som den ledende strengen. DNA-replikering er et annet tilfelle der DNA-strengene har forskjellige navn.
Stop And Go Traffic
Den anti-parallelle strukturen til DNA-stigen betyr at den ene strengen løper fra hode til hale mens den andre strengen løper fra hale til hode. Under DNA-replikering må DNA-polymerase lese og kopiere begge trådene samtidig, selv om de løper i motsatt retning. Fordi DNA-polymerase bare kan lese og kopiere DNA-tråder i en retning - hale mot hode - strengen at Polymerase møter som orientert fra topp til hale, kan ikke leses og kopieres som en kontinuerlig Strand. Denne head-to-tail-strengen kopieres som korte fragmenter, kalt Okazaki-fragmenter, som senere er smeltet sammen til en lang streng. I DNA-replikasjon kalles strengen som dannes i fragmenter den forsinkede strengen.